文章 企业如何选择适合自己的项目管理软件?

...具体来了解都有哪些独到之处！ 一、简洁的项目任务分配与信息全面的甘特图         管理项目在CORNERSTONE中非常的简单，任务里程碑可以清晰表现每个任务的时间期限；任务列表可以编辑与查看任务具体信息；通过看...

文章 一文教你转录组数据如何挖、文章怎么写！

...数据结果似懂非懂，无法做到从海量结果数据里一层一层筛选出关键的研究结果。转录组后续分析及实验无思路，无法完成整个科研闭环！ 解决以上两个问题，一是要真正读懂转录组结果，要知其然更要知其所以然；二是要多...

问题 老师你好，我换了一台32g的电脑，并且启动时给分配了16g的内存，但是依然会如下图报错，用您样本里的数据测试依然是这样，请问怎么回事呀？！

问题 你好，请问做顺势作用元件分析时，小麦分染色体提取时，怎么每条染色体都只提取了一条序列，谢谢老师，可是我内存分配了11个G，应该不是内存不够吧

文章 hmmsearch搜索蛋白保守结构域结果说明

如果是用hmmsearch命令查询我们序列中的保守结构域： hmmsearch --domtblout hmm_WRKY.txt --cut_tc WRKY.hmm Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa target length是我们输入序列总长度；query length 输入的查询序列也就是蛋白结构域的总长度；筛选的时...

文章 胃癌预后signature数据挖掘-自噬基因

...本研究的目的是使用生物信息学分析来分析 GC 中的 ARG，筛选 GC 患者与胃癌相关的预后biomarker。 文章： Front Genet (IF: 3.258; Q1). 2021 Feb22;12:615834. doi:10.3389/fgene.2021.615834. 数据来源： TCGA数据库：375个胃癌病人基因表达数据和...

问题 老师您好，我在听您关于16s数据分析的课程。安装好桌面版docker后，给 docker 分配内存时提示内存不足，但是我的系统内存还有很多。请问如何解决？don't have enough memory

文章 MEME使用参数说明

...based sequence analysis tools)使用说明 MEME是用于从一堆序列中搜索功能结构域的工具。比如说当你拿到了许多CHIP-chip或者CHIP-seq的数据，当分析出峰所处的位置之后可以得到一些这些峰所代表的序列，这就是蛋白质与DNA相到作用所保...

问题 进化树构建

...侠，你的这个基因家族的序列是怎样下载下来的？是直接搜索MYB逐一下载，还是通过结构域批量筛选，或是还有什么便捷的方法能够把这个物种中基因家族的序列下载全的？请大侠赐教，不胜感激。

文章 Molecular Plant | 一个接近完整的拟南芥基因组组装

...织区有缺失的染色体，填补了在Col-CEN和Col-XJTU中的大多数剩余缺口。 作者首先根据ONT的一致性序列用nextdenovo得到初步的基因组，随后结合ONT、HiFi、illumina数据对基因组进行了优化，获得polished组装，此时一共有8个contig，按...

文章 抗独特型抗体制备常见问题解析

抗独特型抗体开发的常见问题解答 一、如何有效筛选出非竞争型抗体？ 首先，在血清效价检测中，使用竞争ELISA的方法对不同动物血清中的免疫反应进行评估，选择竞争抑制率相对低一些的动物进行杂交瘤融合。接下来，在主...

文章 WGCNA筛选Biomarker

...关的基因表达数据构建网络，鉴定关键模块和hub基因，是筛选Biomarker的有效方法，也有助于我们进行后期湿实验验证。 接下来，就给大家讲解一篇过敏性哮喘相关文献，了解其分析思路。 研究背景 过敏性哮喘是一种具有多种...

文章 基因家族docker 镜像使用方法

...##############################################################333#第一次搜索结构域####################################################################################hmmsearch --domtblout WRKY_hmm_out.txt --cut_tc WRKY.hmm Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa###############################...

文章 胃癌免疫侵润预后Signature数据挖掘-糖酵解

...酵解相关基因集：从Molecular Signatures Database v4.0数据库中筛选与糖酵解相关的基因集5个：BIOCARTA_GLYCOLYSIS_PATHWAY, GO_GLYCOLYTIC_PROCESS,HALLMARK_GLYCOLYSIS,KEGG_GLYCOLYSIS_GLUCONEOGENESIS, REACTOME_GLYCOLYSIS，最终从56,639mRNA基因中筛选到326个与糖酵解（...

问题 得到INDEL,在做注释的时候报错。

....000e-01;DP=6109;ExcessHet=160.0000;FS=1.802;InbreedingCoeff=-0.5141;MLEAC=247;MLEAF=0.361;MQ=44.81;MQRankSum=-6.930e-01;QD=15.16;ReadPosRankSum=-8.300e-02;SOR=0.857GT:AD:DP:GQ:PGT:PID:PL:PS0|1:10,9:19:99:0|1:563132_C_T:348,0,393:563132./.:15,0:15:45:.:.:0,45,580:../.:23,0:23:57:.:.:0,57,855:.0|1:13...