问题 tassel 报错

 ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Matrix size exceeds the size of an integer

文章 bwa-mem2的用法

bwa-mem2是指令集优化版bwa mem，它产生与bwa相同的对齐，并且速度约为1.3-3.1倍，具体取决于用例、数据集和运行机器，近期的版本极大降低了内存和存储使用量（使用了FM-index，和 8x compression） 最初的bwa是由李恒开发的. bwa-mem2的...

问题 使用了pop-evol-gwas2.0,还是报错，但是我安装的时候这个2.0特别快，一下就好了。

问题 有2个问题想请问老师，1基因名字字体过大，如何调整字体，2进化树分支线太短，看不清楚，如何将线拉长

提问.docx

问题 linux里不能通过 sudo docker pull omicsclass/samtools:latest，显示连接超时

XXX@ubuntu:~$ sudo docker pull omicsclass/samtools:latest Error response from daemon: Get "https://registry-1.docker.io/v2/": dial tcp 199.96.59.61:443: i/o timeout

文章 很大的压缩文件计算行数

...rt_time).count(); gzclose(input_file); std::cout << "Number of lines: " << line_count << std::endl; std::cout << "Time taken: " << duration << " seconds" << std::endl; return 0; } 这需要一个需要支持C++11或更高版本的编...

问题 求助大佬，circos图chr.info文件怎么整理？

...You did not define a karyotype file. Are you sure your configuration file is well formed? chr.info文件如图所示，全在Linux环境下用脚本整理的，是我哪里搞错了？还是数目太多？（用的scaffold，MCScanX也是，全部600个scaffold放到配置文件就报错，只放...

问题 我想问一下，荧光定量2-△△CT法的-△△CT是等于转录组log2FoldChange，就是说2-△△CT等于FoldChange？

问题 老师我的基因结构分析structure，得出的gene_exon_info.gff是空的

get_gene_exon_from_gff.pl 这是我的脚本能帮我看看吗？

问题 blast2go报错，升级blast ncbi-blast-2.3.0+ 到 ncbi-blast-2.6.0+ 报错

Can not parse BLAST XML because can not find information about the used version!

问题 想咨询一下，我有1批宏基因组数据，可不可以样本对半，分成2次进行

...一步，生成bowtie.sam和fin.sam文件的时候，可不可以分别做2个，就是因为测序批次问题，可不可以分开2次进行去宿主生成.sam文件，然后前后2次所有的文件放在一个文件夹里，一起进行下一步？ 还有，组装的时候，可不可以单样...

问题 tassel计算PCA

ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Index 436980866 out of bounds for length 436980866

问题 tassel 计算PCA

 ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - Index 436980866 out of bounds for length 436980866

文章 群体遗传进化与GWAS分析镜像更新2.0

群体遗传进化镜像已经更新2.0： 1.主要是一些软件升级到最新如：GAPIT，plink，vcftools，一些R包等 2.增加一些软件，dadi 等 3.解决一些bug等，如绘图报错：https://www.omicsclass.com/question/6010 使用方法： docker pull omicsclass/pop-evol-g...

文章 基因组重测序docker镜像更新到2.0

基因组重测序docker镜像已经更新2.0： 1.主要是一些软件升级到最新如：fastp，samtools，bwa，GATK ,一些R包等 2.GATK 更新到4.4.0.0，更新群体大规模Call SNP方法； 3.更新大样本量，并行运行讲解 4.其他代码优化等 使用方法： docker ...