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问题 MENA网站上传数据提示错误

老师好,我在MENA网站上传数据时总出现如下提示 Software error: Couldn't open D:\wwwroot\MENA\ori_files\shy666..\MENAPH1.txt for writing: No such file or directory at D:\wwwroot\mena\upload_result.cgi line 95. For help, please send mail to this site's webmaster, giving this err...

文章 KEGG数据库-pathway对应基因的注释信息下载

我们下载KEGG数据库的目的是为了研究目标蛋白参与了那些pathway 。 前面我们介绍了KEGG 数据库中蛋白序列的下载方式,现在来介绍一下patyway 相关数据的下载方式。这个主要采用KEGG 的API 进行获取,思路如下: 1. KEGG 有那些pathwa...

文章 ImmuCellAI 免疫细胞估算,RNA-seq 和芯片数据

... 在该分析方法中,ImmuCellAI能够基于RNA-Seq或芯片的转录组数据,准确地估计18种T细胞和6种其他类型免疫细胞的比例,包括B细胞,NK细胞,单核细胞,巨噬细胞,中性粒细胞和树突状细胞;同时,该网站还能预测患者对免疫检查...

问题 您好,想问一下苹果电脑的powershell怎么导入数据

您好,想问一下~苹果电脑的powershell怎么导入数据?因为苹果电脑就一个盘,不知道该怎么编辑代码~谢谢~

问题 HGMD数据

老师您好,我在一个帖子中看到您提供了一个HGMD数据库下载的百度网盘链接,可能是时间太久了链接已经失效。 我的需求是这样的,我正在进行一个单基因遗传病的突变位点和表型关系的研究,这个基因不是什么热点基因,遗...

问题 使用qiime2导入数据时,一直报错,不知怎么解决。万分感激!!

老师们你好,我在使用docker做qiime2分析自己的数据时,讲数据导入qiime2这一步时,报错了,manifest文件按照视频里做的,找了很多原因一直都是同样的报错代码,不知道怎么办。麻烦老师可以指教下吗??

问题 二代和三代sv数据合并出现问题,若能回答,万分感谢

用三代数据sv结果对二代数据进行基因分型,合并两个结果时出现问题,bcftools merge合并的结果,缺失率太大,导致用plink进行pca分析时因缺失率太高无法进行,survivor merge 1000 1 1 0 0 50,合并后样本名减少,并且计算Fst为几个固定...

问题 对于标准化的数据应该如何绘制火山图呢?

因为数据有正负之分,此时直接求比值就不能够体现出二者的大小差异,可以作差比较吗?

问题 GEO网站提供数据标准化结果负值

这是其中一个单样本信息,打开之后是这样的 这是我R语言下载得到的基因表达矩阵的一部分 问题:GEO下载下来的表达矩阵数据为什么有负值,能用吗,需要经过转换吗?

文章 R-对NA 数据进行处理

针对存在NA 值的数据进行处理 > dat sample1 sample2 sample2.1A 1 5 8B 2 NA NAC NA 7 10D 4 9 1 将所有空值用0代替 > for(i in 1:ncol(dat)){+ dat[is.na(dat[,i]),i]=0+}> dat sample1 sample2 sample...

问题 如何做生存分析,需要什么数据

文章 dell R730 清除硬盘数据

ctrl+R

问题 基因家族文章里的转录组数据有什么要求

近期想写一篇基因家族的文章,看文献都得加点表达量的数据,这个取材的时候应该怎么取?

文章 5分钟看懂KEGG代谢通路图

... KEGG Pathway分类 一般,KEGG中存在三大类代谢图,每个数据路的pathway都有相应的唯一编号,如map00010,据此可在kegg数据库官网查询: 第一类、reference pathway:根据已有的知识绘制的、概括的、详尽的具有一般参考意义的代谢图...

文章 ggplot2几个主题类型

...示ggplot2几个默认的主题类型,直接套用对应的函数即可 数据参考 https://www.omicsclass.com/article/92 dat   type  Sample Num1     A sample1  902     B sample1  343     C sample1  564     D sample1  995     E sample1  156    ...