您好，当我发现我的PAV文件中不同的fam号对应了同一个基因后，我检查我在32个材料中共鉴定了12359个基因，但生成的Fam_gene.list文件中基因总数为12436 我尝试了重新跑perl $scriptsdir/PAV_list.pl -pangenel apple.WRKYgene.pan-genes.list -spid new_id...
Rscript $scriptdir/deseq_analysis.r -i $workdir/4.expression/all_gene_count.tsv -g S3_vs_S4.compare.txt -k $workdir/4.expression/all_gene_fpkm.tsv -r S3 --fdr 0.01 --fc 2 -p S3_vs_S4 Loading required package: ggplot2 Loading required package: edgeR Loading required package: limma [1] "abstra...
单位需求：想咨询如何做一个科研单位的基因组数据库，或者有没有能够做这一数据库的公司。 对黄河濒危鱼类全基因组序列进行扫描建库，共得到455.4亿个基因碱基原始数据，数据量为156.35 Gb。 对序列片段进行基因组组装，...
...产物在功能上是否有区别。基因家族（Gene Family）：同一个祖先基因经过变异，产生了结构、功能相似的各种表达蛋白，表达这些蛋白的基因统归为一个基因家族。如趋化因子（cytokine）家族成员，大家在结构上均有由1对或2对保...
...多年以来的梦想啊， 副业开挂第二春，一不小心还能发个核心! 真柠檬精附体了，好酸！ 事情是这样的： 这位要发论文的作者，是某小说网站上的一名作者，小说名字叫《我有一座灵异工厂》， 据这位作者自己介绍，她...
1、head&tail命令 # 从第300行开始，显示100行（即显示300~399行） cat filename | tail -n +300 | head -n 100# 显示100行到300行 cat filename| head -n...
在用GenotypeGVCFs合并不同种质的g.vcf文件时，用这样的命令（gatk --java-options "-Xmx50g" GenotypeGVCFs --tmp-dir $tmpdir -R $REF -O all.raw1.vcf.gz -V gendb://db ）。但是我发现生成的 all.raw1.vcf.gz文件中，最前边的不是Chr1。而是Ch4（第四条染色体，...
...响基因表达的因素)，需要进行预先处理。 关于计算多少个隐藏因子，则与样本的数量有关，可以参考如下的标准： The number of PEER factors was selected as function of sample size (N): 15 factors for N < 15030 factors for 150 ≤ N < 25045 factors for...
...体用法如下： n<-round(runif(1000,0,100)) #生成0到100的1000个随机数 hist(n) #频数分布直方图，纵坐标名字为frequency hist(n,freq = F) #频率分布直方图，纵坐标名字为density 选项设置： （1）break 设置断点，有两种方式：...
...了哪些分析！ Results： 1. MAPK基因家族鉴定 共鉴定到14个MAPK家族基因，并根据其磷酸化作用位点划分为3个亚家族，其中MAPK14有2个拷贝，具体信息见下表： 2. MAPK家族基因复制分析 以上14个MAPK家族基因在不同物种中相对保守...
...测试的骨髓靶向免疫疗法的机制。 数据下载地址： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146771 数据下载与预处理代码： 这个数据有点特殊是smartseq的单细胞数据，为全长数据，并且已经做TPM标准化： #数据下载 wget -c htt...
..._size=30 #文字字体大小 label_snuggle=yes #如多个文本文字距离过近，避免重叠 参考：https://www.omicsclass.com/article/678 show_links=yes #显示标签和染色体之间的连接 link_color=black #连接线颜色 ...
...则如下： $a = "1234567890"; $a =~ s/(?<=\d)(?=(\d{3})+\b)/,/g 此外，我们在网易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因...