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文章 Pacbio三代无参全长转录组(Iso-Seq) 的转录本合并策略

...Cogent的一种分析策略     1.2    也支持一定的序列质量筛选,比如覆盖度等。 2 缺点     2.1 软件运行时间长,速度比较慢。而且Cogent软件的安装比较麻烦     2.2 结果不容易理解:Cogent会对序列先进行聚类划分,之后对序列...

问题 采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时,用inner_distance.py报错。

...ributionNotFound(req) pkg_resources.DistributionNotFound: pysam 网上也搜索了报错信息,还是不明白,不知道怎么解决。

文章 多基因组基因水平共线性分析

...ks grape.cacao.i1.blocks --noheader | cut -f1,2,4,6 > grape.blocks 筛选关注的区域进行展示,这里展示前50列: $ head -50 grape.blocks > blocks2 blocks2文件格式如下: GSVIVT01012261001 . . GSVIVT01012259001 ppa005716m . GSVIVT01012258001 . . GSVIVT01012257001 ppa...

文章 比较好发、版面费又便宜的期刊推荐?

...出快速网络出版,即文章在被接收后30个工作日左右即可分配DOI号,上线网络版,以便被阅读、下载、引用。大家可以自己去了解一下。4,关于版面费一般国际期刊是不收取版面费的,不同于国内的出版,国外的学术期刊大都由...

文章 手把手教你在线分析转录因子结合调控分析(植物)

...子进行分析,并可以对转录因子进行富集分析,这就可以筛选出关键作用的转录因子。结果如下: 5. GO 富集分析    针对一组基因进行GO富集分析,分别从分子功能,细胞组份和生物过程3个方面进行功能富集分析。 学会利...

文章 看懂变异记录结果文件(VCF)

...标记完之后我们就可以用其他工具,把标记为"PASS"的列给筛选出来,这样方便后续分析。如果没有应用缺失值"."代替。INFO 为附加信息列,一般以=;形式添加额外的注释信息列,常见的如DP=18 表示该位点测序深度为18X;AF=0.1表示...

文章 抗体开发过程中的常见问题及解决方案详解

...4℃,如果实验周期较长,可添加50%甘油,保存在-20℃,剩余量分装后保存至-80℃,可保存2-3年。     九:我怎么判断一种抗体是否可以从某个未测试的物种中检测出? 不能保证抗体在未测试过的物种中的性能,即使序列比...

文章 盘点:科研学术圈不为人知的行业“黑话”

...老板指课题组内负责人,小老板指辈分较后,受其他老师分配任务的老师【有点像总经理和各部门经理的关系一样】 大牛:某一领域的佼佼者,通常拥有非常多的荣誉和头衔。在各类会议上谈笑风生那种。 小牛:正在向大牛...

文章 敏捷开发实践之Scrum方法运用

...。为适应这种开发环境和市场需求,传统的软件开发模式被敏捷开发模式所替代。本文介绍敏捷软件开发中的Scrum方法,并结合实际问题,分析Scrum方法在实践中的运用。   关键词:敏捷开发;Scrum   产品质量和开发效率一直是...

文章 考研倒计时19天:双非大学的研究生还有用吗?

...! 这条路并不好走,先不说考试的难度了吧,就说说资源分配的问题, 好大学的资源是稀缺的,哪有那么多985/211等着你去读, 所以,大多数人会面临一个问题:双非大学的研究生,读还是不读? “考研不考985、211?那还不...

文章 《Nature》发文描述几百万年间柑橘如何从喜马拉雅山到我们的餐桌

...过程,研究人员分析了58种现有柑橘品种的基因组(包括发表的柑橘属果树的基因组和30种本研究新测序的基因组),如澳洲青柠、墨西哥酸橙,美女桔、金橘、克里曼丁橘和佛手柑等。研究结果于2018年2月刊发在《Nature》上。...

文章 给进化树标定化石时间

...一个共同祖先,而每个末端的分支(叶节点)代表现存或灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一个时间框架,便于超度量树的构建 1. 化石时间哪里找? TIMETREE这个网站收录了很...

文章 时隔4年,四川大学华西医院全球首个CRISPR人体实验结果出炉!

...了研究)。 2. 基因编辑效果:T细胞中位编辑效率是5.81%,与未被编辑的T细胞相比,在被编辑过的T细胞中,CD8和IFN-γ双阳性的占比显著增加。这表明,破坏T细胞的PD-1之后,T细胞的活性增强了;基因编辑的效率在8.7%-31.2%之间...

文章 《基因家族分析实操》直播培训(第二期)火热报名中!

...正的阻碍是你的犹豫不决,当你还在徘徊时,别人的论文经见刊了,心动不如行动,想学的赶紧来参加组学大讲堂(专业生信教学团队,网络课程学员超20000人!)举办的《基因家族分析实操》直播(第二期)吧!共7节课,...

问题 电脑内存不能升级,运行Rstudio内存一直上升,请问还有其他方法解决这个问题吗。

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