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问题 R语言下载GSE数据一直在报错

... ## 平台文件 Found 1 file(s) GSE95394_series_matrix.txt.gz Failed to open file C:\Program Files\R\GSE95394_series_matrix.txt.gz.curltmp.File stored at: ./GSE95394_series_matrix.txt.gz 错误于downloadFile(url, destfile = destfile, mode = "wb"): Failed to download ./GSE95394_series_matri...

问题 R语言下载GSE数据一直在报错

... ## 平台文件 Found 1 file(s) GSE95394_series_matrix.txt.gz Failed to open file C:\Program Files\R\GSE95394_series_matrix.txt.gz.curltmp.File stored at: ./GSE95394_series_matrix.txt.gz 错误于downloadFile(url, destfile = destfile, mode = "wb"): Failed to download ./GSE95394_series_matri...

问题 gtf文件获得基因长度报错

老师，您好，我在做转录组分析的时候，利用get_gene_length_from_gtf.py脚本获得基因长度的时候报错，如下图： 而我的gtf文件如下图： 不知道什么原因，生成gene.bed文件时时正常的，谢谢！

问题 dadi

...ar库 gtfToGenePred -genePredExt $gtf unknown_refGene.txt retrieve_seq_from_fasta.pl --format refGene --seqfile $fa --outfile unknown_refGeneMrna.fa unknown_refGene.txt table_annovar.pl $data/goat.recode.vcf ./ -buildver unknown -out snp -remove -protocol refGene -operation g -nastring . -vcfin...

文章 R 安装包：configure: error: proj_api.h not found in standard or given locations.

...hecking for sys/stat.h... yeschecking for sys/types.h... yeschecking for unistd.h... yeschecking for gdal.h... yeschecking GDAL: linking with --libs only... yeschecking GDAL: /usr/share/gdal/pcs.csv readable... nochecking GDAL: checking whether PROJ is available for linking:... yeschecking GDAL: che...

文章 利用qiime2对微生物扩增子测序数据文库根据barcode信息拆分数据

... 参考：https://forum.qiime2.org/t/demultiplexing-and-trimming-adapters-from-reads-with-q2-cutadapt/2313 课程推荐：微生物扩增子分析课程实操     微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读

问题 docker gene-family image 执行时perl脚本不出现

perl script/mRNAid_to_geneid.pl Arabidopsis_thaliana.TAIR10.41.gff3 mRNA2geneID.txt 在执行这个指令时，出现：Can't open perl script "script/mRNAid_to_geneid.pl": No such file or directory 错误，是perl脚本没有封装在容器中吗？

文章 NCBI、ENA高通量测序数据下载-fastq数据

...负责维护，隶属于美国国立卫生研究院（National Institutes of Health, NIH）。 ENA：https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home；欧洲核苷酸序列数据库（European Nucleotide Archive），由欧洲分子生物学研究室（European Molecular Biology Laboratory，EMBL）开发...

问题 老师我在构建泛基因列表，合成last.txt文件，结果只有两列

...lue = float(row[2]) # 假设第三列是数值 IndexError: list index out of rang 我的结果是这样 老师是这样

问题 docker desktop命令不能运行

C:\Users\Administrator>docker run --rm -v D:/blast:/work -it omicsclass/blast-plus:latest docker: Error response from daemon: status code not OK but 500: {"Message":"Unhandled exception: Drive has not been shared"}. See 'docker run --help'.

问题 老师您好，下载镜像失败显示这个该怎么解决？

Error response from daemon: Get "https://registry-1.docker.io/v2/": net/http: request canceled while waiting for connection (Client.Timeout exceeded while awaiting headers)

问题 docker 安装

...安装，出现报错界面Installation failed: Containers Windows Feature is not available，我已按照参考资料https://www.omicsclass.com/article/1303的步骤新建了containers.cmd，并以管理员身份运行完成后重启了电脑，再次安装时依然出现这样的界面，应该怎...

文章 fuzzywuzzy模糊匹配和提取

...比如我这里使用基因 #!/usr/bin/env python3 import pandas as pd from fuzzywuzzy import process # 假设有一个小的基因名称列表，可能是你关注的几个基因 my_genes = pd.DataFrame({ 'My_Gene_Name': ['BRCA1', 'TP53', 'EGFR', 'XYZ'] }) # 假设有一个基因数据库...

文章 FGF21突变让你吃多甜食也不发胖？

...N, Jones S E, et al. A Common Allele in FGF21 Associated with Sugar Intake Is Associated with Body Shape, Lower Total Body-Fat Percentage, and Higher Blood Pressure[J]. Cell Reports, 2018, 23(2): 327-336.

文章 华为敏捷项目管理实践分享

...重及以上级别问题，或者总遗留DI值（遗留缺陷密度）>x分，则服务质量不达标，不允许发布。 重点提一下质量回溯会议，对应于敏捷迭代回顾会议，是华为持续改进的实践瑰宝。其要义是塑造整个团队对事不对人、勇于直...