文章 生化检测是什么？生化检测试剂盒该怎么选？

...居然有11分的文献引用！ Lee H Y, Back K. Melatonin induction and its role in high light stress tolerance in Arabidopsis thaliana [J]. Journal of pineal research, 2018. 这个J Pineal Res期刊，2018年IF=11.613，也是很牛了！！ 学霸姐姐大致看了一下，这篇文章主...

问题 我运行遗传群体进化的fst_pi_select_sweep.r这个脚本一直报错Error in dev.off() : cannot shut down device 1 (the null device)，将dev.off()语句改为while (!is.null(dev.list()))  dev.off()依旧报错，怎么解决？

文章 qiime2 vsearch OTU 以及 ASV流程整理

...2.1.7报错 qiime tools import --input-path $workdir/otu_table.biom \ --type 'FeatureTable[Frequency]' --input-format BIOMV100Format \ --output-path table_biom.qza qiime tools import --input-path $workdir/otus.fa \ --type 'FeatureData[Sequence]' \ --output-path repset-seqs.qza ### 方法3. ...

文章 Scanpy数据结构：AnnData

...等。 import scanpy as scsc.tl.pca(adata)sc.pl.umap(adata, color='cell_type') 1.5 数据存储： Anndata 可以将数据存储为HDF5文件，以便将数据持久化和共享。 adata.write('my_data.h5ad')

文章 ggplot2隐藏图例

...56,99,15)C = c(50,20,24,70,14)dat = data.frame(A,B,C)names(dat) = c("type","sample1","sample2")dat = melt(dat,variable.name="Sample",value.name = "Num")head(dat)p = ggplot(dat, aes(x = type,y = Num,fill = Sample))+  #####这部分的position_dodge(width=0.8)大于宽width = 0....

问题 qiime2 v1.4版，用data2生成特征表时出错，应该怎么解决？ Plugin error from dada2: An error was encountered while running DADA2 in R (return code 1), please inspect stdout and stderr to learn more. Debug info has been s

文章 R语言如何绘制MA图

... length(args) != 2 ) {    print(args)    usage()    stop("the length of args != 6")}plot_MA <- function(log10exp=NULL, log2FC=NULL, FDR=NULL, Significant=NULL,        xlab="log10(FPKM)", ylab="log2(FC)", main="MA plot") {    # check args    # chec...

文章 vscode更新导致低版本系统无法登陆的问题

...pyright (C) 2023 Free Software Foundation, Inc. This is free software; see the source for copying conditions. There is NO warranty; not even for MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. Written by Roland McGrath and Ulrich Drepper. 版本够,如果不够你就下载一下新版的然...

文章 简单科普：2019诺贝尔生理学或医学奖为啥颁给“细胞感受氧气”？

...霸姐姐想以三位大佬中的威廉·凯林的一句话结尾： “The most dangerous result in science is the one you were hoping for, because you declare victory and get lazy.” ——科学中最危险的结果就是你所希望的结果，因为你会宣布胜利并变得懒惰。 大...

文章 Vennerable包的安装

...ors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/") library(devtools) ###Use reshape2 instead of reshape install_github("js229/Vennerable") 1、最好先安装依赖的包，以免影响软件安装 2、安装devtools  并加载，以便能够使用安装命令install_github 3、利用install_github 安装 Ven...

问题 老师，请问在进行基因结构分析时，运行perl ../script/get_gene_exon_from_gff.pl -in1 DOG1_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt . -in2 ../GWHAAAL00000000.gff -out gene_exon_info.gff 代码为什么输出的文件无内容呢

文章 TCGA中癌症的名称，简写和中文名称

...asive carcinoma 乳腺浸润癌 CESC Cervical squamous cell carcinoma and endocervical adenocarcinoma 宫颈鳞癌和腺癌 CHOL Cholangiocarcinoma 胆管癌 COAD Colon adenocarcinoma 结肠癌 COADREAD Colon adenocarcinoma/Rectum adenocarcinoma Esophageal carcinoma 结直...

文章 不同物种基因组之间的比对与可视化

...chr之间的间隔比例(ChrWidth*ChrSpacingRatio)#Main = "main_Figure" ## the Figtur Name #font-size strokewidth=1; fill="green"ChrSpacingRatio=0.5 ## 不同染色体chr之间的间隔比例###### 默认各层的配置参数 若各层没有配置的会，则会用这儿的参数 ######SetParaFor = ...

问题 MCScanX报错

Reading control file error: For input string: "800     //plot width and height (in pixels)" Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: Width (0) and height (0) cannot be <= 0 at java.awt.image.DirectColorModel.createCompatibleWritableRaster(DirectColorModel.java:1016) at...

文章 perl脚本批量生成反向互补序列

...  must be given-fa fasta file <infile> must be givenOther parameter:-h           Help documentUsage End.exit;}my $in  = Bio::SeqIO->new(-file => "$opts{fa}" , -format => 'Fasta');open(OUT,">$opts{out}") ||die "open file $opts{out} faild.\n";while ( my $seq = $i...