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文章 华为是如何绝地反击,强势崛起的?(2)

...亚。 你们现在的位置我很喜欢,我会用自己技术带来的更好体验说服消费者,他们会用钞票投票给我,让我取代你们。质量与数量,我全都要。 我以前没有将来也不会借助禁止对手进入市场主渠道这种手段增加销量数字,我...

文章 给进化树标定化石时间

...种用来表示生物之间进化关系的树状图。在进化树中,每分支点(节点)代表一共同祖先,而每末端的分支(叶节点)代表现存或已灭绝的物种。给进化树标定化石时间,即在进化树上标注时间点,为进化树提供了一时...

问题 Fam_genelist中基因数超出了所有的鉴定的数据

您好,当我发现我的PAV文件中不同的fam号对应了同一基因后,我检查我在32材料中共鉴定了12359基因,但生成的Fam_gene.list文件中基因总数为12436 我尝试了重新跑perl $scriptsdir/PAV_list.pl -pangenel apple.WRKYgene.pan-genes.list -spid new_id...

文章 mapman非模式植物基因注释时遇到的问题

...兼容。 解决:全部换到版本4能用的就解决了,新图效果更好,推荐。 顺便指路pathway下载界面MapManStore - MapMan (gabipd.org),按需求之。

问题 老师,求助,转录组差异表达基因分析报错

Rscript $scriptdir/deseq_analysis.r -i $workdir/4.expression/all_gene_count.tsv -g S3_vs_S4.compare.txt  -k $workdir/4.expression/all_gene_fpkm.tsv -r S3 --fdr 0.01 --fc 2 -p S3_vs_S4 Loading required package: ggplot2 Loading required package: edgeR Loading required package: limma [1] "abstra...

问题 如何构建鱼类物种种质资源基因组数据库?

单位需求:想咨询如何做一科研单位的基因组数据库,或者有没有能够做这一数据库的公司。 对黄河濒危鱼类全基因组序列进行扫描建库,共得到455.4亿基因碱基原始数据,数据量为156.35 Gb。 对序列片段进行基因组组装,...

文章 基因家族(family)与基因超家族(superfamily)的区别在哪里?

...产物在功能上是否有区别。基因家族(Gene Family):同一祖先基因经过变异,产生了结构、功能相似的各种表达蛋白,表达这些蛋白的基因统归为一基因家族。如趋化因子(cytokine)家族成员,大家在结构上均有由1对或2对保...

文章 某网络小说作者:我要去发篇Nature了,小说停更。。。。

...多年以来的梦想啊, 副业开挂第二春,一不小心还能发核心! 真柠檬精附体了,好酸! 事情是这样的: 这位要发论文的作者,是某小说网站上的一名作者,小说名字叫《我有一座灵异工厂》, 据这位作者自己介绍,她...

文章 【Linux】查看文件中的某几行(中间几行)

1、head&tail命令 # 从第300行开始,显示100行(即显示300~399行) cat filename | tail -n +300 | head -n 100# 显示100行到300行                                                         cat filename| head -n...

文章 使用peer根据表达量数据推断隐藏因子

...响基因表达的因素),需要进行预先处理。 关于计算多少隐藏因子,则与样本的数量有关,可以参考如下的标准: The number of PEER factors was selected as function of sample size (N): 15 factors for N < 15030 factors for 150 ≤ N < 25045 factors for...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-结直肠癌 CRC(GSE146771)

...测试的骨髓靶向免疫疗法的机制。 数据下载地址: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE146771 数据下载与预处理代码: 这数据有点特殊是smartseq的单细胞数据,为全长数据,并且已经做TPM标准化: #数据下载 wget -c htt...

问题 P值与矫正后P

最近分析的好多组数据矫正后P值都是这样,或者干脆全部是1,用limma包分析的,请问这是什么原因导致的呢?能不能直接用P值呢?

文章 circos-基因组圈图绘制软件基础绘图

..._size=30   #文字字体大小        label_snuggle=yes #如多文本文字距离过近,避免重叠 参考:https://www.omicsclass.com/article/678        show_links=yes   #显示标签和染色体之间的连接        link_color=black #连接线颜色    ...

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