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问题 WGCNA分析生成的单个模块txt文件非常大,请问老师有没有什么好的方法能打开?以及找到的如下代码如何使用?谢谢

...的方法,不知道对不对,如果不对,老师是否有代码能够打开或者拆分大的txt文件?大概5G 这段代码,有个问题,就是filename这里是否要改成自己的文件名?eachfile_lines_num这里呢?就这样放着,还是改成一个数值? file_split <...

问题 IF=6.68|肝癌单细胞数据挖掘实践(附代码)

老师您好,这篇文章的代码您有吗 公众号百度云链接已经取消分享了

问题 细胞测序生成的图片基因名字字体比较小,需要修改什么参数

下面这个图的两张图片基因名字字体比较小,如何调整

文章 blastall 搜索比对输出结果 m8或者m9格式说明(blast+ m6格式

blastall运行命令如下,m8和m9格式差不多,一个不带表头,一个带表头,使用方法如下: blastall -i Arabidopsis_thaliana.TAIR10.pep.all.fa -d HSP20_NCBI_pep.fasta -p blastp -e 1e-10 -b 1 -v 1 -m 8 -o ncbi_hsp20.out 输出结果表格如下: Query id  Subject id ...

问题 细胞拎亚群后重新聚类分析,需要重新整合吗

...tumor cell这个cluster出来,然后reanalysis的umap感觉不同代数细胞好像是单独成簇的,正常嘛?

问题 swissport功能注释

在进行基因组swissport注释时,注释到了一个细胞器基因(结果见下图1),把这个基因单独拿出来,进行nr注释,可以比对到近缘物种的叶绿体上(见下图2),但是将整条contig拿出来做nr注释,就得没有该叶绿体基因的注释信息(...

问题 系统发育树:基因结构比较散,长度差异大,如何绘制满意的系统发育树?

...得不齐,比对结果如下 删除空白gap后: 导出mega formate打开:比对结果如下,只有一列保守的区域,显然不符合一个基因家族的特性 使用的软件是MEGA,采用了clustalw和Muscle两种方法,比出的结果都不尽人意。 于是绘制了该...

问题 老师您好,我在做WGCNA分析时,无法打开'9.Module_membership文件,相关报错截屏和操作文件已发布,请问老师,是哪一步出了问题?该如何解决?谢谢老师。

trait.txtlncRNA_expressionMatrix.rar

问题 细胞测序数据两个子集合并

我想把CD4.added.celltype.rds文件和subsetCD8.reanalysis.rds文件进行合并,但是这两个文件的最后一列列名不同无法进行合并,有什么办法可以修改列名或者删除这一列呢? CD4.added.celltype.rds对应的meta文件:CD4.added.celltype.metadata.tsv subsetC...

文章 时隔4年,四川大学华西医院全球首个CRISPR人体实验结果出炉!

...学华西医院卢铀教授研究小组计划利用 CRISPR 技术编辑的T细胞(敲除 PD-1 基因)治疗转移性非小细胞肺癌患者。 全球首例,国际领先,一时,报道铺天盖地,实验结果更是令公众翘首以盼;不过,之后该实验信息报道渐少,...

问题 蛋白质全长多序列比对

...tput WRKY_pep_final_aligned.fasta这一步出了问题,请问这种情况怎么调整呢?

文章 GATK4

...学习链接:WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘?学习链接:转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容:linux、perl、R语言画图,更多免费课程请点击以下链接: htt...

文章 centos7用户管理 linux

...linux用户账号分类 超级用户: root  拥有对系统的最高的管理权限  UID=0 普通用户:系统用户 UID: >=500           UID:即每个用户的身份标示,类似于每个人的身份证号码. 虚拟用户:伪用户  一般不会用来登录系统的,...

文章 免疫共沉淀CoIP实验过程步骤详解,so easy !!

...究蛋白质相互作用的经典方法,是确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用的有效方法。 当细胞在非变性条件下被裂解时,完整细胞内存在的许多蛋白质-蛋白质间的相互作用被保留了下来。当用预先固化在琼脂糖凝珠(arg...

问题 测序的数据txt格式如何转换成fasta格式