CGVIEW：微生物基因组分析软件 简要介绍： 微生物基因组分析软件： GC含量，GC skew- ，GC skew+ 计算； ORF，起始密码子，终止密码子等的检测。 网站地址：http://wishart.biology.ualberta.ca/cgview/ 使用过程：（以一组基因分析为例...
Broad GDAC对TCGA的结果进行了整理和深入分析，相关的原始数据和分析结果可以通过网页的方式进行查看和下载， 网址如下：http://gdac.broadinstitute.org/ 点击Cases可以查看对应的样本信息，点击Data可以下载对应的结果文件，点击Bro...
...预测蛋白质的三维结构和功能。它使用多个方法，如模板匹配、折叠识别和自由建模，来预测蛋白质结构。 2. 原理: I-TASSER使用以下步骤来预测蛋白质结构： 线程: I-TASSER首先使用线程技术搜索已知蛋白质结构的数据库，找到...
单因素方差分析的用途 方差分析用于两个及两个以上样本均数差别的显著性检验，是研究一个或多个自变量与一个连续的因变量之间的统计关系，并且测定自变量对因变量的影响和作用的一种统计方法。 方差分析最简单的形...
...库收费以后，很多单位的KEGG数据库还是用曾经免费的那版本，一直没有更新。由于现代测序技术和信息技术的发展，KEGG数据库有很多的更新，所以更新KEGG数据库是非常有必要的，一般来说需要更新的信息包括，蛋白序列，蛋白...
...程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学...
准备好分析需要的文件，在GSEA官网下载分析软件（软件可以免费下载，需要配置java环境）就可以进行GSEA分析。 打开分析软件，第一步是载入数据，如下图所示，点击红箭头指向的1出的Load data会出现右边的界面，从箭头2处点...
...用子程序语法格式： subroutine(参数列表); 在 Perl 5.0 以下版本调用子程序方法如下： &subroutine(参数列表); 在新版本上，虽然也支持该调用方法，但不推荐使用。 接下来我们来看一个简单是实例： 实例#!/usr/bin/perl # 函数定...
...:v2.0 如果需要用到最新的软件分析数据可以使用这个2.0版本的镜像，老用户重新下载示例数据压缩包 课程链接：https://bdtcd.xet.tech/s/29EigM
WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联，以及网络中的核心基因。适用于复杂的数据模式，推荐15个样品以上的数据。现在测序价格越来越...
用fq文件，bam文件，vcf文件分别重新跑，都会出现下面的问题。。。。qtlseq的版本已经更新到最新了
请问遗传进化中的R版本是多少呢，在自己的服务器中跑脚本总是跑不出
...下： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）...
...异位点是否与xQTL共享相同的因果变异,还可以使用共定位分析来推断遗传变异位点是否通过调控基因表达或其他分子表型（如剪接、甲基化）来影响性状 那么在此基础上，给大家引入一个新的概念——孟德尔随机化 （Mendelian Ra...