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问题 R中apply同时计算行和列使用c(1,2)，为什么不起作用

... 4    6    8 question：上述使用了c(1,2)来同时计算行和列的平均值，但为什么结果仍旧是原矩阵？

文章 CentOS 7 清理删除卸载 Docker 环境

...mount /var/lib/docker/devicemapper 6. 卸载 docker     查看已安装的 docker 包 # yum list installed | grep docker     卸载相关包 # yum remove docker-engine docker-engine-selinux.noarch sudo yum –y remove docker-buildx-plugin.x86_64 docker-ce.x86_64 docker-ce-cli.x86_64 doc...

问题 叶绿体基因组GetOrganelle组装时出现killed，内存从10G改为30G又改成70G，但是还是不行，程序终止。

1、在get.sh.o文件中，出现：Retrying with more reads。 2、GetOrganelle_out文件夹中只有，没有组装的序列结果。

问题 计算KaKs时，axt文件中两序列长度一致，但是仍然提示“not equal”（详情见下图）

这是我截的图，具体可见长度相同，下边我把具体序列贴出来。 Gh_A03G1821.1&Gh_D12G0330.1MLSGLMNLLRACFLPRSDRHVHTSSENGGRQDGLLWYKDSGQHFNGEFSMAVVQANNLLEDQSQLESGCLSLHESGPYGTFVGVYDGHGGPETSRYINDHLFQHLKRFTSEQQGMSADVIRKAYQATEDGFLSLVTKQWPMKPQIAAVGSCCLVGVICNGTLYVANLGDSRAVLGRAVKATGE...

问题 picard.jar安装，已从网站上下载picard.jar 2.6.0运行jar -O picard.jar显示 Illegal option: O需要怎样改正

改为0后需要添加怎样的参数

文章 subset_row.r 提供列表，在行上取数据子集

...t file name prefix [default demo] 参数说明： -i 输入要取子集的数据， ID TCGA-D7-A74A-01A-11R-A32D-31 TCGA-BR-7704-01A-11R-2055-13 TCGA-VQ-A91N-01A-11R-A414-31 TCGA-CD-A4MH-01A-11R-A251-31 TCGA-BR-7715-11A-01R-2055-13 TCGA-EQ-8122-01A-11R-2343-13 TCGA-BR-7704-11A-01R...

文章 BWA mem比对报错 paired reads have different names 解决

...s情况，导致比对出错 问题解决：采用bbmap进行fastq文件的修复 1.软件安装 conda安装 conda install -c bioconda bbmap 或直接安装 wget https://nchc.dl.sourceforge.net/project/bbmap/BBMap_39.01.tar.gz 2.fq文件修复 sh ./repair.sh in=r1.fq in2=r2.fq out=r1.rep...

文章 TCGA癌症数据库挖掘发表的大文章CNS级别汇总2019

TCGA Research Network Publications A comprehensive list of publications by The Cancer Genome Atlas program. This list is updated as the TCGA Analysis Network continues to study and mine the data. Cancers Selected for Study lists original marker publications by cancer type. Supplemental and ...

问题 无法链接到docker守护进程

...containerd/blob/main/docs/PLUGINS.md#version-header" 然后我按照GitHub的导航操作了还是没解决这个报错，请问我改怎么解决这个问题？

问题 无法链接到docker守护进程

...containerd/blob/main/docs/PLUGINS.md#version-header" 然后我按照GitHub的导航操作了还是没解决这个报错，请问我改怎么解决这个问题？

问题 建立共享文件夹失败错误提示wrong fs type, bad option, bad superblock on bioshare

... info is found in syslog - try       dmesg | tail  or so按照网上的方法sudo apt-get install nfs-common尝试解决，但是没有

问题 自己LDdelay时，绘制不出图且ld.bin.gz和ld.stat.gz文件大小只有1kb，请问问题出在哪里？

利用《群体遗传进化课程》提供的原始数据，步骤如PCA，structure等都能重复出结果，但LDdelay绘图时，出不了图。 教程中此步本应该输出更多文件，包括LD绘制图，但是实际只输出了以上3个文件。

问题 用hisat2软件建立index为什么要先制作splicesites.tsv和exons.tsv文件

老师给的命令 hisat2_extract_splice_sites.py chr22_with_ERCC92.gtf > splicesites.tsvhisat2_extract_exons.py chr22_with_ERCC92.gtf > exons.tsvhisat2-build -p 8 --ss splicesites.tsv --exon exons.tsv chr22_with_ERCC92.fa chr22_with_ERCC92 请问这样比直接 hisat2-build好在什么...

问题 磷酸转运蛋白家族（PHT1）在Pfam上关键字搜不到pfam 号，在文章中也没有提到，请问这个家族有隐马尔可夫模型么？

用NCBI搜索PHT1，有一个保守结构域，但是这个保守结构域其他基因家族也有，不是特异的

问题 R语言怎么写循环，对多个元素进行重复操作？

...ed.ID)例如上述命令行，怎么用“XXX”来代替需要重复运行的元素，循环运行XXX_id = data.frame(XXX$Mapped.ID)