文章 pubmed按影响因子分类文献

...： "CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS"[journal] or "NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE"[journal] 添加完影响因子大于30的之后，再重复上述4步把其他影响因子范围的杂志分别建立到不同的filter当中，这样自定义的过滤器就完成了；最后勾上激活过滤...

文章 怎样画一张曼哈顿图CMplot

...，每种性状单独一列。 CMplot绘图 > CMplot(pig60K, plot.type="m", multracks=TRUE, threshold=c(1e-6,1e-4),threshold.lty=c(1,2),         threshold.lwd=c(1,1), threshold.col=c("black","grey"), amplify=TRUE,bin.size=1e6,        chr.den.col=c("darkgreen", "yellow",...

文章 下载TCGA临床信息

...数据类型 project <- "TCGA-STAD" data_category <- "Clinical" data_type <- "Clinical Supplement" legacy <- FALSE # 设置工作目录 setwd(work_dir) # 下载临床数据的结果 DataDirectory <- paste0(work_dir,"/GDC/",gsub("-","_",project)) # 查询可以下载的数据 query ...

文章 docker启动报错：Error starting daemon: SELinux is not supported with the overlay2 graph driver on this ke

...cker -l 报错：Error starting daemon: SELinux is not supported with the overlay2 graph driver on this kernel. Either boot into a newer kernel or disable selinux in docker (--selinux-enabled=false) 解决方案： 意思是说：此linux的内核中的SELinux不支持 overlay2 graph driv...

问题 装完linux虚拟机后，不能和windows实现共享怎么解决呢？出现了这个/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: Protocol error

文章 用R语言快速合并大量表格文件

...file=x,header=T,sep = "\t",check.names = F)})dd=join_all(datalist,by="id", type="full")  #注意指定文件共同的列明by， type 也有left 以第一个文件ID为准，right，inner  取交集，full 取并集write.table(dd,file ="merged.all.tsv",sep="\t",quote = F,row.names = F)

问题 请问mapman分析kegg时，总提示这个 Data does not fit mapping used (no data points mapped),please choose the appropriate mapping which matces your data

请问mapman分析kegg时，总提示这个 Data does not fit mapping used (no data points mapped),please choose the appropriate mapping which matces your data

问题 老师您好，今天利用docker进行基因家族分析进入组学大讲堂虚拟机时报错，之前一直正常

...pipe%2Fdocker_engine/v1.40/containers/create: open //./pipe/docker_engine: The system cannot find the file specified. In the default daemon configuration on Windows, the docker client must be run elevated to connect. This error may also indicate that the docker daemon is not running. See 'C:\Progra...

文章 快速生成iTOL配置文件美化你的进化树

...           key = "itol_3al_1_labels",                      type = "LABELS",                      tree = tree_1)write_unit(unit_1,paste0(getwd(),"/itol_3al_1_labels_Genus.txt"))# tree_colors range by phylum 按照门填充颜色unit_2 <- create_unit(data = data_1 %>% ...

文章 使用picard对参考序列建索引时报错“java.lang.IllegalArgumentException: File is not a supported reference file type”

...java.lang.IllegalArgumentException: File is not a supported reference file type: Bromus_tectorum.faa at htsjdk.samtools.reference.ReferenceSequenceFileFactory.lambda$getFastaExtension$0(ReferenceSequenceFileFactory.java:253) at java.base/java.util.Optional.orElseGet(Optional.java:364...

文章 NCBI上下载参考基因组信息

... 点击之后，就进入下载页面： 注意，点击Download the RefSeq assembly与Download the GenBank assembly都可以下载物种的全基因组信息，但是Download the GenBank assembly会提供RNA、蛋白的一个gff格式文件，而Refseq上没有（gff.是一个基因注释...

问题 /sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: Protocol error 模拟器设置公共文件夹时候出的错实在不知道从何下手

文章 perl中读取和写出Excel的包，xls，和xlsx

...); # Add a worksheet $worksheet = $workbook->add_worksheet(); #  Add and define a format $format = $workbook->add_format(); # Add a format$format->set_bold();$format->set_color('red');$format->set_align('center'); # Write a formatted and unformatted string, row and column notation...

问题 bioconductor一直安装不对

...'https://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/4.2/lme4_1.1-31.zip' Content type 'application/zip' length 4525485 bytes (4.3 MB) downloaded 4.3 MB 程序包‘lme4’打开成功，MD5和检查也通过 下载的二进制程序包在 C:\Users\陈立新\AppData\Local\Temp\RtmpGgnxVM\downloaded_pack...

文章 plotrix包画扇形图

...以借助plotrxi包中的fan.plot函数 以dat数据为例： > dat  type Num1    A  902    B  343    C  564    D  995    E  15 ggplot2绘制的结果如下图（https://www.omicsclass.com/article/415）： 利用fan.plot绘制的扇形图如下： > library(plotrix...