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问题 输入绘制circos图时出现错误

...perl /home/manager/share/scipt/circos.pl --chr chr.txt --circle link.txt --type link --circle text.txt --type text --od circose1但是显示Can't open perl script "/home/manager/share/scipt/circos.pl": No such file or directory,哪位老师能知道解决的方法?

文章 国宝吃竹子并非发自内心-比较基因组学分析揭示大熊猫“心路历程”

... Q, Ma S, et al. Comparative genomics reveals convergent evolution between the bamboo-eating giant and red pandas[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2017, 114(5):1081-1086.

文章 NCBI下载SRR并转换为fastq文件

...cation | Genome Biology | Full Text (biomedcentral.com) 数据可用性:The entire genome resequencing data have been deposited at GenBank under the accession PRJNA356989.  想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据,看了一些下载教程,方法各异,看完思路还是...

问题 共享文件夹出现/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: No such device此命令怎么解决

文章 Pacbio三代全长转录组(Iso-Seq ) 纠错软件-HECIL

HECIL(Hybrid Error Correction of Long Reads using Iterative Learning):  这是一款基于二代数据比对,采用迭代学习的方法对pacbio 等长读长序列进行纠错的软件。该软件的第一作者居然是来自IBM。 1. 软件的安装 安装比较简单,从github 上下载...

文章 RDA CCA 分析Hellinger转化问题

...frow = c(2, 2))#ordiplot(pca_sp1, scaling = 1, display = 'site', type = 'text')#ordiplot(pca_sp2, scaling = 1, display = 'site', type = 'text')#ordiplot(pca_sp3, scaling = 1, display = 'site', type = 'text')ordiplot(pca_sp1, dis = 'site', type = 'n', choices = ...

文章 蛋白质组和转录组相关性图绘制

... by.x='protein_id', by.y='#ID') # 基于调控关系进行分组 merge_df$type <- paste(merge_df$regulate_p, merge_df$regulate_g,sep = '_') types <- c('Down_Down','Down_Up','Up_Down','Up_Up') merge_df[!merge_df$type %in% types,'type'] <- 'Other' # 绘图 mycol <- c("#e41a1c","#ff7f00"...

文章 基因组注释流程,PASA mysql 数据库启动 exited

...--verbose --help --log-bin-index=/tmp/tmp.ogWM7TzzGmmysqld: Can't read dir of '/etc/mysql/conf.d/' (Errcode: 2 - No such file or directory)mysqld: [ERROR] Fatal error in defaults handling. Program aborted! 由于是mysql5.7更新导致的,解决方法有三个, 1.取消-v参数: ...

问题 win10 中docker 下载镜像报错:no matching manifest for windows/amd64 10.0.18362 in the manifest list entries

文章 下载TCGA临床信息

...数据类型 project <- "TCGA-STAD" data_category <- "Clinical" data_type <- "Clinical Supplement" legacy <- FALSE # 设置工作目录 setwd(work_dir) # 下载临床数据的结果 DataDirectory <- paste0(work_dir,"/GDC/",gsub("-","_",project)) # 查询可以下载的数据 query ...

文章 怎么用Perl脚本得到反向互补序列

...everse_complement_IUPAC {        my $dna = shift;        # reverse the DNA sequence        my $revcomp = reverse($dna);        # complement the reversed DNA sequence        $revcomp =~ tr/ABCDGHMNRSTUVWXYabcdghmnrstuvwxy/TVGHCDKNYSAABWXRtvghcdknysaabwxr/;        return $revco...

文章 pubmed按影响因子分类文献

...: "CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS"[journal] or "NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE"[journal] 添加完影响因子大于30的之后,再重复上述4步把其他影响因子范围的杂志分别建立到不同的filter当中,这样自定义的过滤器就完成了;最后勾上激活过滤...

文章 用R语言快速合并大量表格文件

...file=x,header=T,sep = "\t",check.names = F)})dd=join_all(datalist,by="id", type="full")  #注意指定文件共同的列明by, type 也有left 以第一个文件ID为准,right,inner  取交集,full 取并集write.table(dd,file ="merged.all.tsv",sep="\t",quote = F,row.names = F)

文章 docker启动报错:Error starting daemon: SELinux is not supported with the overlay2 graph driver on this ke

...cker -l 报错:Error starting daemon: SELinux is not supported with the overlay2 graph driver on this kernel. Either boot into a newer kernel or disable selinux in docker (--selinux-enabled=false) 解决方案: 意思是说:此linux的内核中的SELinux不支持 overlay2 graph driv...

问题 装完linux虚拟机后,不能和windows实现共享怎么解决呢?出现了这个/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: Protocol error