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文章 小白也能画漂亮热图--赐你一个非编程热图工具

...章加分,各位老师学生也是做足功课了!但是不会编程敲代码?——那必须学学各种绘图小工具了。 热图是属于生命科学类型文章中非常常见一种图片了,此前小编教过大家如何用Excel来画热图(戳这里了解一下啊),但是...

文章 在R里绘制地图

...重要方面,其提供了多种方法和工具包来绘制地图,包括基于经纬度数据地图、行政区划图等。今天教大家使用ggmap、maps这两个包,进行地图绘制。 ggmap 1 代码 ggmap包能够从多种在线地图服务(如 Google Maps、OpenStreetMap、St...

文章 论文查重?给你推荐几个好用网站!

...法纠错、近义词替换建议、标点符号、格式、时态纠正等功能;另外该网站也可以检查文章雷同,功能很是齐全! 网址:www.grammarly.com 7. Plagiarism Checker Plagiarism Checker网站功能很齐全,既可以审核文件,又可以检查网页,...

文章 @程序猿,还在无休止加班吗?

...尽可能做到提早集成,频繁集成,一般每添加进一些新代码时,最好都做一次集成,不要临到软件发布或者交付当天才开始集成,也不要很久才集成一次,如此可以尽早发现代码问题,保持软件状态一直是可用。 i...

文章 敏捷开发——互联网时代软件开发方式

...适产品。这使得组织更具竞争力,但当存在无穷尽功能更新和其他修复任务时,我们也很难界定某些任务是否可以标记已经完成。(图CORNERSTONE需求管理页面)二、敏捷中完成定义了解了相关背景后,让我们来回答前...

文章 NCBI下载SRR并转换fastq文件

...the AWS CLI - AWS Command Line Interface (amazon.com) 三、SRR文件转换成fastq文件 使用NCBI提供SRA-toolkit中工具fastq-dumpSRR文件转换fastq格式双端测序文件拆分两个reads nohup fastq-dump --split-3 --gzip ./SRR6382584 & #SRR文件需...

文章 Treemix 软件:群体基因交流分析得力工具

...传关系,数值大小体现关系紧密程度。 .modelcov.gz 文件:基于构建模型计算协方差矩阵,用于评估模型对实际数据拟合程度。 .llik 文件:记录了不同模型对数似然值,数值越大表示模型对数据拟合越好,可用于模型...

文章 pySCENIC转录因子分析结果解读

...构建共表达网络。GENIE3(随机森林)/GRNBoost(Gradient Boosting):基于共表达情况鉴定每个TF潜在靶点,推断转录因子与候选靶基因之间共表达模块。每个模块包含一个转录因子及其靶基因。这个共表达网络只是基于TF和gene表达量相...

文章 如何按照影响因子筛选文章--PubMed文献搜索技巧

...呢? 接下来,小编就给大家分享PubMed数据库一个高级功能来解决这个问题(文末提供制作好过滤器下载)。 PubMed影响因子过滤器 首先,打开PubMed网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,按下图说明点击“Signin to NCBI”,输入...

文章 再挖TCGA,发篇SCI

...从UCSC Xena 下载相应肝癌miRNA数据。 2. 差异表达分析 基于374份肝癌样本和50份癌旁样本基因,lncRNA,和miRNA表达数据,进行差异表达分析,筛选差异表达分子。 差异表达火山图如下: 差异表达聚类热图如下: 3....

文章 R语言宽型与长型数据转换tidyr包

... 1.3 0.2 setosa 使用gather()函数进行数据重塑(代码中'%>%'管道函数,这也是我们什么要载入dplyr包原因,关于管道函数,详见R Language Learning:dplyr包(十一)) > iris %>% + gather(key=var1,value = var2,...=1:4,na.rm =...

文章 win10 安装最新基于WSL2docker

...desktop启动Docker Desktop for Windows,点击“设置”按钮,启用基于WSL2引擎复选框(Use the WSL 2 based engine)在 Resources WSL Integration中设置要从哪个 WSL2 发行版中访问 Docker,如下图使用是 Ubuntu。重启 Docker desktop for Windows,重启完...

文章 linux下samtools安装指南

...数据分析中最重要一环,无论是转录组还是重测序都是基于比对结果来进行后续各项分析,比对结果格式比较常见是sam和bam文件,例如转录组Tophat分析软件输出比对结果.bam文件,而重测序中BWA、bowtie等比对软件则主...

文章 组学生物招贤纳士!

...生物信息分析服务,目前公司提供服务包括两类:一是基于高通量测序技术(二代、三代测序)基因组测序、分子标记开发、功能基因定位、疾病位点检测、个性化医疗以及分子标记辅助育种;二是以生物大数据处理技术...

文章 文章问题撰写及发布审核要求

...不重视这个问题,也不重视回答者感受。很多人没有把代码 包裹起来,我们也视排版混乱。没有代码或者用图片代替了代码。这是一个最近比较突出问题,代码胜千言,准确简短描述配上必要代码,比你说一大堆废...