找到约 15 条结果

文章 sankey_plot.r绘制桑基图

...pic inches [default 5] 参数说明： -i    包含具有对应关系的数据 Immune_Subtypem6aclustergroupC1C2highC2C1low -g    输入所要绘制桑基图的三列数据的列名 -c    决定分流所填充颜色的列名 使用举例： Rscript script/sankey_plot.r -i /share/nas...

问题 报错出现“Non-unique name 'IRIS_313-7' in the alignment”

请教一下，我在构建进化树的时候出现这个报错，是不是因为我整理数据的时候有重复的单个文件呀？遇到这种情况，我应该怎么处理呢？

问题 提取蛋白序列报错

请问我在提取蛋白序列的时候报这样的错误是什么原因啊？

问题 基因组注释 genome.chain 文件生成问题

老师您好，请问我在用 omic 的镜像生成 genome.chain 文件时，出现 KeyError: 'ptg000026l:::fragment_1' 的错误，老师该如何解决？ 下面是我 genome.agp 文件中出现 fragment 的内容： Chr15   29259691        30651746        15      W       ptg000...

问题 基因家族成员鉴定

老师您好，请问我最后得到的物种特异蛋白ID为什么与网页版hmmersearch得到的ID对不上呢？

问题 基因家族建树

我现在在做一个比较常见的基因家族，然后鉴定的家族成员有点多，这导致我需要用保守结构域建树，想问下老师应该怎么用保守结构域建树。

问题 基因家族鉴定

老师好，在进行基因家族成员鉴定时，可以同时使用Hmmer search和blast比对这两种方法吗？最终的鉴定结果取2者结果的交集，可行吗？

问题 医学数据库

各位大神，现在有没有比较新，能用来快速发文的医学数据库，或者研究方法。发文周期比较短可以用来毕业的

问题 共线性

请问老师，全基因组跑出来的共线性和基因家族跑出来的共线性结果不同，也就是基因家族共线性结果有些在全基因组共线性中找不到，这种情况应该怎么处理？

问题 转录组数据

老师您好，我想画热图，所以在GEO数据库中下载了转录组数据，但是我发现下载的数据基因ID和我的对不上，这怎么办呢？

问题 java安装问题

你好，想要安装ECLIPSE，并且也下载了您给提供的java，eclipse的安装包，但是安装java时出现了问题

问题 转录组测序

老师您好，我的转录组测序GC含量为什么都是向下的趋势呢？我看别人做的都是一个平行线。图中这样属于GC分离吗？谢谢。

问题 进化树构建

老师您好，构建我想使用水稻、拟南芥和大麦的所有几丁质酶成员构建进化树，需要添加外群吗？如果需要的话，外群序列该怎么选择呢？

问题 docker镜像设置

按照教程已经安装好了docker，设置镜像时的内容和教程上的不一样，按照教程的更改之后也不能保存，显示错误

问题 vcftools --gzvcf all.varFilter.vcf.gz --recode --recode-IN.............els |gzip - > clean.vcf.gz这一步输出的vcf.gz文件，用 bcftools query -l clean.vcf.gz | wc -l查看样本名出现报错

Failed to read from clean.vcf.gz: unknown file type 0 这是为什么呢