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文章 食管癌相关文章ESCC

...的治疗效果差异与体肿瘤免疫细胞组成的异质性有关,更好地了解ESCC微环境中的免疫细胞生物学将有助于确定细胞反应性或免疫疗法耐药性的潜在机制。 研究思路: 文章标题:单细胞转录组测序揭示食管鳞癌新辅助治疗...

文章 免疫疫微环境(TIME)

...胞可影响癌细胞增长和发育。 对于免疫微环境有一流行的学说——“种子与土壤”学说,肿瘤的发生发展是肿瘤细胞与其微环境相互影响、共同进化的结果。肿瘤微环境由不同种类的间质细胞和炎性介质以及细胞外基质...

文章 拿到转录组分析结果后还应该干点什么?

...录组分析结果阅读指南,可以让大家对分析结果的组成有基本的认识。 但是看懂了标准分析结果到利用数据撰写文章,还差一步,我们还需要对标准分析结果进行性化分析才能用到文章里,下面我就来总结8最常用的转录...

问题 HGMD数据库

...MD数据库么 我们团队在做先心病的核心家系研究,基于60家系发现novel associated mutation的文章倒是好写,但是易感突变在临床上其实意义不大,我们始终想在临床上把这些患者家系给诊断清楚,经过层层筛选后我们一家系能...

问题 使用bio-linux中sratoolkit里prefetch下载数据,但是无法打开试过用自带的sratoolkit,也自己去下了最新版的放在用户文件夹也不行,我按照网上的教程设置环境变量,用source ~/.zshrc使配置生效了(好像bio-linux用bashrc不行?),但是无论如何也打不开,不知道哪里出了问题,有大佬知道吗,小白实在不懂

文章 假如腾讯阿里消失了,这社会将变成什么样?

...欢到处塞钱,哪里都有他们资本的影子。。。 其实这现象现在大部分人都能感觉到。 但今忽然想到了问题:如果阿里和腾讯有一天突然消失了,会发生什么? 说说腾讯这边,首先你的微信和 QQ 都别想用了。。。 这...

文章 OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

...推断出同源基因集合(Orthogroup);     1.2 (b)基于每同源基因集合(Orthogroup)进行构建基因的进化树(Unrooted gene trees);     1.3 (c/d)基于所有的同源基因的进化树的情况,推断物种的有根树(Rooted species tree)。基于STAG...

问题 基因家族分析--结构域在线数据库中确认

...的NCBI-CDD的确认 和 smart 网站确认的过程中, 发现在这两网站分别有几基因不含有目标结构域, 这样的话, 这几基因是否要去除?

问题 docker工具的高级用法中的问题

根据视频06中28分钟的方式,新建了一w.sh的文件,然后根据命令去运行,发现只出现了aa6.fa, aa1-5.fa这5文件并没有出现的方式,新建了一w.sh的文件,然后根据命令去运行,发现只出现了aa6.fa, aa1-5.fa这5文件并没有出现。...

文章 木薯NBS基因家族分析

...,但是具体怎么操作,很多同学还是不清楚。今天就用一完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。 读前准备知识点 1. NBS-LRR是最大的抗性基因家族之一 ; 2. 根据N端的Domains不同NBS-LRR分为...

问题 circos不能正常生成配置文件

把准备的几文件都放在circos目录下,几文件如下 gff文件CM.gff: list文件CM_WRKY.collinear.pairs: colline文件CM.collinearity: 生成配置文件的命令如下: perl ../script/colline_v2.pl -gff CM.gff -list CM_WRKY.collinear.pairs -colline CM.colline...

问题 WGCNA可以将来自不同组织的表达量数据放在一起计算吗

各位老师: 请问WGCNA可以将来自不同组织的表达量数据放在一起计算吗? 我有四不同组织的表达量,每组织三重复,可以当作12样本将表达量进行WGCNA分析吗

文章 2019年转录组文章该怎么写?

...累的机制。 1、实验材料: T.media、T.mairei、T.cuspidata三品种,每品种准备了5棵独立的树。 2、使用HPLC-MS/MS测定紫杉醇含量,检测发现,T.cuspidata的紫杉醇含量最高,T.mairei的紫杉醇含量最低。 3、每品种3生物学重复...

文章 蛋白信号肽预测—SignalP使用详解

...导新合成的蛋白质向分泌通路转移的短肽链,长度约5-30氨基酸;对应的mRNA序列,在起始密码子后,有一段编码疏水性氨基酸序列的RNA区域,该氨基酸序列就被称为信号肽序列,它负责把蛋白质引导到细胞含不同膜结构的亚细...

问题 泛基因家族系统发育树

...家族成员鉴定时,没有核心基因,90%为私有基因(一共950),在图上的表现就是比较散。同时,图上中间有一些没有用颜色标记的几分枝,不需要标吗,分成几亚类呢,如何说各亚类的功能,在写文章时,不知道该怎么...