从事生物信息分析的老师和同学一般都会接触SRA数据，下载SRA数据的方法也有很多，这里来简单总结一下。 方法一：SRA Tookit下载 SRA Tookit 是NCBI 提供的下载软件，我们需要下载安装，下载地址：https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/...
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...达谱数据；数据集要求包含骨肉瘤转移和未转移这一分类信息。共获得四个数据集：GSE14359、GSE21257、 GSE32981、GSE14827。 数据分析 1.数据预处理 从GEO数据库下载四个数据集对应的芯片平台不同，将按照不同的方法进行处理。GSE1...
...据挖掘 R语言画图 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理...
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...印机，IP地址为192.168.1.88。 这里可跳过。 信息收集，可随便填写。 安装完成，打印机连接成功。 3.使用 打印时选择以下打印机即
老师您好，我在用GSDS作图出来后，黑笔圈出来的按键部分一直不显示，改变不了图片信息。
这是我的代码：perl script/get_fa_by_id.pl MYB_id.txt Phaeodactylum_tricornutum.ASM15095v2.pep.all.fa > MYB_id.fa 这是报错信息：perl script/get_fa_by_id.pl <idlist> <fa> <OUT> at script/get_fa_by_id.pl line 4.
...程：GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理...
...，有时会利用错配探针信号，而有时并不会参考错配探针信息。譬如，常见的 RMA算法进行数据标准化并未利用到mm信号值，mas5 方法则要参考mm进行计算。 因此在实际分析的过程中需要明确对应的affymetrix芯片 是不是包含两种探...
...果保存格式，优点是可将OTU或Feature表、样本属性、物种信息等多个表保存于同一个文件中，且格式统一，体积更小巧，目前被微生物组领域几乎所有主流软件所支持 BIOM目前分为1.0 JSON和2.0 HDF5两个版本1.0 JSON是编程语言广泛...
您好，我在使用以下代码进行格式整理后发现，部分出错 awk -F"\t|-|_" '{print $1$2"\t"$3"_"$4}' 13Pan-genes.list > apple13.pan-genes.list 我的13Pan-genes.list文件如下 整理后的文件如下，有部分基因如Msi开头的没有加上第三列的信息
...择坐标系截断（gg.map等）的方式去展示于结论更加相关的信息。但是截断毕竟会损失部分信息，如果想要更加全面地展示，数据转换是一种不错的方式。 1. 指数型——使用logn(y)进行转换 原始数据： 代码： p <- ggplot(df, a...