...们单细胞课程的学员利用我们提供的脚本快速的分析公共数据做数据挖掘，这里开始记录一下不同公共数据相关分析shell代码。大家有了我们的代码就可以照抄分析，提高分析数据效率，今天是第1个数据，后续还有数据慢慢给大...
老师好，请问昆虫重测序数据某些样品比对率较低，怀疑是肠道内容物污染DNA，但是样品的QC报告中（统计reads的平均GC含量的分布）为什么是单峰？一般文库污染是双峰或者多个峰。。。然后将未比对的数据去blastNT数据库除了...
我最近在下载hgmd的突变数据，但是用biomaRt包一直下载失败，求老师分享一下，非常感谢！
...分析，涉及的主要函数是roc函数和plot.roc函数： 以自带数据为例： > library(pROC)> data("aSAH")> head(aSAH,10) gos6 outcome gender age wfns s100b ndka29 5 Good Female 42 1 0.13 3.0130 5 Good Female 37 ...
...均值进行相应修改，如果可以，那么修改原则是什么，是数据集中的波峰前取值还是波峰中间取值，比如图2波峰是300bp，那么我是否可以取值280？
高通量测序得到很多SNP，但是要找到用最少的SNP数据区分尽量多的样品，也就是指纹图谱DNA fingerprinting。这里介绍一个软件可以做这个事情： SNPT下载地址：http://www.shigatox.net/stec/cgi-bin/snpt 这个软件可以做的分析： Indentify uniqu...
老师您好！请问，在数据集合并中，GSE1既有正常组样本，又有疾病组样本，而GSE2只有疾病组样本。这种情况能合并吗？
老师您好，我学习得知TCGA中count数据是需要标准化后才能使用，请问我能否使用edgeR的TMM方法标准化，不进行差异分析，用标准化后的文件进行GSEA以及基因相关性等分析？TMM标准化时是否一定需要设置过滤标准去除表达量很低的...
因为.TEM数据大概319MB，高达300万行数据，excel不能完全打开，R不能读取全部。所以应该怎么实现？
...因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，...
pfam数据库一般是可以打开的，但是如果想搜索的话是不行的： Please note: this site relies heavily on the use of javascript. Without a javascript-enabled browser, this site will not function correctly. Please enable javascript and reload the page, or switch to a different b...
...预测疾病进展、治疗反应和生存率等重要临床结果。根据数据类型、研究目标和所需的解释性，可以选择不同的统计和机器学习模型。以下是一些常见的预后预测模型 统计模型 Cox比例风险模型（Cox Proportional Hazards Model）...
转录组数据看不懂？转录组数据不会挖掘？你没遇到对的组织！阅读下方信息，加入组织，彻底玩转转录组，赶在年前把手里的转录组数据利用起来，把文章投出去！ 组学大讲堂（学员20000+人的专业生信教学团队）精心为您筹...
在获取原始数据的时候，打开发现有的gene表达量，在一个对照中，正常组高表达，而肿瘤组中无表达，这样的数据怎么进行FC的计算。能否采取给这些零值赋予极低的表达量，还是单纯的删除这些无法得出FC值，因为注意到有p...