今天为大家介绍一个有名的搜索蛋白互作网络的数据库：STRING。教大家如何制作一个蛋白互作网络 STRING数据库介绍： nString数据库是一个搜索已知蛋白质之间和预测蛋白质之间相互作用的数据库，该数据库可应用于2031个物种，...
您好 双通芯片，应该怎么寻找差异基因。如果想单独看癌或者癌旁的表达量，是需要访问原始数据吗？
高通量测序得到很多SNP，但是要找到用最少的SNP数据区分尽量多的样品，也就是指纹图谱DNA fingerprinting。这里介绍一个软件可以做这个事情： SNPT下载地址：http://www.shigatox.net/stec/cgi-bin/snpt 这个软件可以做的分析： Indentify uniqu...
...族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读 3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCN...
...限于马铃薯可用 相关课程推荐：转录组标准分析后的数据挖掘 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读...
文本路径已经修改，但是在表达数据处理时代码出错，文件路径显示为模板路径
利用Vennerable可以进行绘图，以包自带的数据绘图如下： library(Vennerable)data(StemCell)w <- Venn(Sets=StemCell[1:2])plot(w, type="squares") 组别标签位置进行调整 可以基于VennGetSetLabels 和VennSetSetLabels 进行，前者获取当前绘图对象的Set标...
...们单细胞课程的学员利用我们提供的脚本快速的分析公共数据做数据挖掘，这里开始记录一下不同公共数据相关分析shell代码。大家有了我们的代码就可以照抄分析，提高分析数据效率，今天是第1个数据，后续还有数据慢慢给大...
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老师好！下图是我使用Trimmomatic处理数据后的FASTQC质检报告，tile质量有warning，但是考虑到已经使用软件过滤掉了低质量的reads，这一项是否可以不做处理？另外overrepresented sequence也有warning，考虑到是rna-seq数据，是否可以忽略...
老师您好，通过查阅文献可知要用Draper这个做参考基因组做基因家族鉴定，这个那个基因组数据和我们课程上讲的示例不一样，可以用这个做吗
...分析，涉及的主要函数是roc函数和plot.roc函数： 以自带数据为例： > library(pROC)> data("aSAH")> head(aSAH,10) gos6 outcome gender age wfns s100b ndka29 5 Good Female 42 1 0.13 3.0130 5 Good Female 37 ...
老师好，请问昆虫重测序数据某些样品比对率较低，怀疑是肠道内容物污染DNA，但是样品的QC报告中（统计reads的平均GC含量的分布）为什么是单峰？一般文库污染是双峰或者多个峰。。。然后将未比对的数据去blastNT数据库除了...
我最近在下载hgmd的突变数据，但是用biomaRt包一直下载失败，求老师分享一下，非常感谢！
...均值进行相应修改，如果可以，那么修改原则是什么，是数据集中的波峰前取值还是波峰中间取值，比如图2波峰是300bp，那么我是否可以取值280？