文章 混合线性模型中BLUE值 VS BLUP值 计算育种值与GWAS表型性状数据整合

... 0.3015  ##  Residual             3.48151  1.8659  ## Number of obs: 575, groups:  lines, 209; env, 3## ## Fixed effects:##             Estimate Std. Error t value## (Intercept)  60.8465     0.2511   242.3我们可以得到遗传方差（即lines的方差）和残差方...

问题 利用getGEO函数下载GSE数据时提示“Error in open.connection(x, "rb") : cannot open the connection”下载GDS，GPL和GSM都是正常的。

我就觉得奇怪了，下载GDS.GPL和GSM的时候都是正常的，就是这个GSE下载不了，就这样提示，谢谢！

文章 TCGA数据库挖掘-肾细胞癌相关biomiarker筛选案例解析

...考文献：Yin, X. , Wang, J. , & Zhang, J. . (2018). Identification of biomarkers of chromophobe renal cell carcinoma by weighted gene co-expression network analysis. Cancer Cell International,18(1). 相关课程： TCGA-基因差异表达分析、 TCGA-生存分析 、 GEO芯片...

问题 老师，使用plantcare网站时，提交后老是显示the reference contains illegal characters, please revise (only alpha-numeric allowed)这句话，仔细看了看没发现符号错误啊

问题 Linux中FOR循环做BWA比对报错[main_samview] fail to read the header from "-".

按照重测序课程中的命令 for i in CB2 CB3; do echo  "RUN CMD: bwa mem  Prunus_dulcis.T2T.assembly.fa ${i}_1.fq.gz \ ${i}_2.fq.gz -t 10 -M \ -R '@RG\tID:${i}\tLB:${i}\tPL:ILLUMINA\tSM:${i}' \ |samtools view -bS -h - > ${i}.bam" nohup bwa mem  Prunus_dulcis.T2T.assembly.fa ${i}_...

问题 老师我在构建泛基因列表，合成last.txt文件，结果只有两列

...lue = float(row[2]) # 假设第三列是数值 IndexError: list index out of rang 我的结果是这样 老师是这样

问题 麻烦求助，在使用ncbi_gff_2_Ensembl_gff.pl这个脚本的时出现报错显示：cant find the string terminator "Usage end"...in line 10

问题 您好iqtree2运行的时候报错，“You should increase checkpoint interval from the default 60 seconds”，请问可能是什么问题呢？docker虚拟机CPU：16 core，Memory：64 GB。谢谢！

文章 华西博士3年发46篇SCI论文，论文高产的秘诀你知道吗？

...了一下邓同学的46篇文章， 发现这46篇文章中， Original research 16篇，其它Comments 9篇，Meta分析10篇，另有letter to the editor若干。 平均下来，每篇大概是2~3分的影响因子， 总体来看，邓博士基本上走的是低分高产的路线， 但是...

问题 我下载了vbox之后按照教程安装了biolinux，但是却卡在了共享文件夹的步骤，报错是/sbin/mount.vboxsf: mounting failed with the error: No such file or directory

文章 GATK报错：Could not find walker with name: VariantFiltration

...one or more arguments or inputs in your command are incorrect. ##### ERROR The error message below tells you what is the problem. ##### ERROR ##### ERROR If the problem is an invalid argument, please check the online documentation guide ##### ERROR (or rerun your command with --help) to view allowab...

问题 基因组注释进行deepTE 分类时报错，The TensorFlow library was compiled to use SSE4.1 instructions, but these aren't available on your machine. Aborted (core dumped)

文章 RNA测序阐释大豆产量调控网络和关键基因

... 参考文献： Du Juan,Wang Shoudong,He Cunman et al. Identification of regulatory networks and hub genes controlling soybean seed set and size using RNA sequencing analysis.[J] .J. Exp. Bot., 2017, 68(8): 1955-1972.

文章 RNA测序阐释大豆产量调控网络和关键基因

... 参考文献： Du Juan,Wang Shoudong,He Cunman et al. Identification of regulatory networks and hub genes controlling soybean seed set and size using RNA sequencing analysis.[J] .J. Exp. Bot., 2017, 68(8): 1955-1972.

问题 转录组自主分析的差异基因分析和KEGG富集分析时发生错误，求老师解答。

...omType = opt$idtype, toType = opt$totype, OrgDb = opt$ann.db) :   26.02% of input gene IDs are fail to map... --> No gene can be mapped.... --> Expected input gene ID: --> return NULL... NULL Error in (function (classes, fdef, mtable)  :   unable to find an inherited method for fu...