NR NT 数据库： #wget -c https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/taxonomy/taxdump.tar.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2acc_lmdb.db.gz#wget -c https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/livelists/gi2acc_mapping/gi2accession.py#wget -c https://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/...
...基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读2. 转录组数据理解不深入？图表看不懂？点击链接学习深入解读数据结果文件，学习链接：转录组（有参）结果解读；转录组（无参）结果解读3. 转录组数据深入挖掘技能-WGCNA，提...
test.csv
GEO中单细胞转录组数据不同数据类型可以用不同参数读入： IF=5.6|GBM单细胞数据挖掘实践：https://www.omicsclass.com/article/1673 IF=6.68| HCC肝癌单细胞数据挖掘实践： https://www.omicsclass.com/article/1677 BCC 基底细胞癌（GSE123813 count表...
...因子，连续变量无法mapped to shape，譬如基于上一文章相同数据dat dat X Y shape1 1 6 02 2 6 13 3 6 24 4 6 35 5 6 46 1 5 57 2 5 68 3 5 79 4 5 810 5 5 ...
您好 双通芯片，应该怎么寻找差异基因。如果想单独看癌或者癌旁的表达量，是需要访问原始数据吗？
文本路径已经修改，但是在表达数据处理时代码出错，文件路径显示为模板路径
今天为大家介绍一个有名的搜索蛋白互作网络的数据库：STRING。教大家如何制作一个蛋白互作网络 STRING数据库介绍： nString数据库是一个搜索已知蛋白质之间和预测蛋白质之间相互作用的数据库，该数据库可应用于2031个物种，...
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...含三域微生物（细菌、古菌、真核）rRNA基因序列的综合数据库，其数据库涵盖了原核和真核微生物的小亚基rRNA基因序列（简称SSU，即16S和18SrRNA）和大亚基rRNA基因序列（简称LSU，即23S和28SrRNA）。目前其最新数据库版本为SILVA SSU ...
老师您好，通过查阅文献可知要用Draper这个做参考基因组做基因家族鉴定，这个那个基因组数据和我们课程上讲的示例不一样，可以用这个做吗
利用Vennerable可以进行绘图，以包自带的数据绘图如下： library(Vennerable)data(StemCell)w <- Venn(Sets=StemCell[1:2])plot(w, type="squares") 组别标签位置进行调整 可以基于VennGetSetLabels 和VennSetSetLabels 进行，前者获取当前绘图对象的Set标...
upup
老师好！下图是我使用Trimmomatic处理数据后的FASTQC质检报告，tile质量有warning，但是考虑到已经使用软件过滤掉了低质量的reads，这一项是否可以不做处理？另外overrepresented sequence也有warning，考虑到是rna-seq数据，是否可以忽略...