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文章 30岁博士毕业正常吗?施一公“不受毕业年限的限制”惹争议

30岁,是人生的一重大的节点。 学霸姐姐在小时候畅想未来的时候, 觉得自己30岁应该是家庭美满、儿女双全、事业有成, 现在看来,这目标,怕是要往后拖很久很久很久了。 大家读博都读了几年? 对于这问题,学...

问题 测序数据比对

...a可以直接bwa比对吗,不再做课程中讲的质控/ 3.由于是120样本,所以数据是120文件夹名为(W1A-W120A),每文件夹里面包含了两测序数据文件-1.fq和-2.fq(如图),读取这一段循环怎么写比较好呢?

文章 细胞STR鉴定有用吗?发论文一定要做STR鉴定吗?

...的情况也同时存在着。   首先,学霸姐姐想问大家一问题:认错了细胞系会造成什么后果呢?   稍微想一下,就知道后果很严重——   1、浪费时间和科研经费;   2、实验结果不可重复、科研结果不可靠;   3、...

问题 安装circos时,模块显示有问题

安装circos时,安装所缺少的模块时,root下所有使用./circos -module模块显示都是ok,但是退出root有四显示是missing,但用whereis找这模块都能找到,请问是什么原因?

问题 blsatp,我想拿发表文献的基因ID的蛋白序列和我自己搜出来的序列($species.gene.pep.fasta)比对。我先是把这两序列放在一起。然后再建库比对。出现问题。怎么办?后来我在那gene.pepe.fasta中选择几序列和发表文献的序列放在一起建库比对就能行。原因是什么?我

问题 mutmap方法为什么必须要有回交过程?

...状等)突变体。后续对茎色进行突变表型筛选,在M7代1000品系中,筛选获得30茎色为紫色的突变体,难道不可以不经过回交,直接将这30品系分别提取DNA,然后再等量混合进行二代全基因组重测序,从而扣 snp,以定位到基...

文章 docker虚拟化技术及其在生物信息数据分析中的应用(linux)

...处。传统虚拟机技术是虚拟出一套硬件后,在其上运行一完整操作系统,在该系统上再运行所需应用进程;而容器内的应用进程直接运行于宿主的内核,容器内没有自己的内核,而且也没有进行硬件虚拟。因此容器要比传统虚...

问题 关于动植物基因组组装课程mysql_server.sh

...数如何更改?我能查到的是-v对应singularity中的-B,其它-p  --name  -e  -d 该如何修改? mysql_server.sh脚本文件中: #启动镜像 docker run -p 3399:3306 --name mysql_pasa \ -v $PWD/log:/var/log/mysql \ -v $PWD/data:/var/lib/mysql \ -v $PWD/conf:/etc/mysql \ ...

文章 还不知道,如何选择适合自己的项目管理软件?

...的功能。 8、安全性能因素 有些项目管理软件有相对更好的安全性。如果安全问题很重要,那么就要特别注意对项目管理软件、每项目文件及每文件数据资料的限制访问方式。        我们应该在实际应用的过程中...

文章 linux用户管理命令介绍

...4、给已有的用户增加工作组usermod -G groupname username  (这会把用户从其他组中去掉) usermod -a groupname username 或者:gpasswd -a user group 如果添加了用户,添加了组,然后使这组里的人都可以sudo 到公共账号下 可以/etc/sudoers.d ...

文章 博士生存现状:被延期、被退学、抑郁自杀、Science“官方劝退”

...真的热爱的话,那还是去做些别的事情吧,未尝不是一更好的选择。最后:好好读书,依然是通向美好未来的捷径即便各方都劝退,学霸姐姐还是想说,那些名校毕业的博士们薪资待遇还是会明显高于普通人,这是一条捷径,...

问题 老师您好,我最近在鉴定的一基因家族,它没有专属的PF号,只有两具有PF号的保守结构域,但是具有这两种保守结构域的不止这一类蛋白,hmm搜索筛查之后剩下了90多基因,但是正常的家族成员应该只有20-40,我可以用拟南芥里已知的成员做进化树来进一步筛选吗?

文章 安装R包报错C++17

再安装R包是遇到以下报错,解决方法记录一下。 这GCC版本问题;设置一下用新版本就行了;这在终端运行;立竿见影。 #module load GCC/7.2.0-2.29 然后: mkdir -p ~/.R echo 'CXX17 = g++ -std=c++17 -fPIC' > ~/.R/Makevars

问题 docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时,即聚类生成OTU-denovo时老是报错,查看类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多样本减成2样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下:

...类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多样本减成2样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下: pick_de_novo_otus.py -i qiime.fasta -f -o pick_de_novo_otus \ >     -p otu_params_de_novo.txt /biosoft/min...

问题 老师我想请问一下有关基因家族成员鉴定出来命名的问题,麻烦老师指导一下

...自己研究的物种中的A基因家族成员命名为A1吗?那这样有问题就是如果自己研究的物种中的A基因只有15,那么有一A基因和拟南芥中的A20基因同源性最高,那我不可能命名为20吧,因为自己所研究的物种中只有15,或许我...