...较任性。一般是不能同源建模（一致度＜30%）的蛋白选用这个方法。
...要每次都判断 # 删除空目录或文件，如果目录不为空，这个方法将会失败。path("path/to/your/file.txt")->remove;# 删除一个非空目录及其内容path("path/to/your/directory")->remove_tree; 临时文件或目录的创建，临时文件在流程结束后会自...
... 文章中，作者也将野生亲本测序了，因为作者对这个亲本做了一些列的研究，我们根据参考基因组计算SNP-index（与参考基因组不同的reads占总reads的比例），对应的，在ΔSNP-index中显著大于或者小于0的位点，都应该作为...
...GO富集分析的网站 GOrilla: http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il/ 可以针对几种比较常见的动植物进行GO富集分析。 1、第一步是选定物种，下拉列表中的物种涉及了以下几种： Arabidopsis thaliana 拟南芥Saccharomyces cerevisiae...
...间转录组分析，做更牛的个性化分析，绘更漂亮的图，点这个链接：单细胞/空间转录组分析实操 2. 2区文章发文新思路，0实验就能发文章，省钱省时间，套路化内容好写易发表，0基础学习最新版基因家族分析/泛基因家族分析...
...起实验来也会得心应手，如有神助。 实验室的垃圾大致可以分为3大类——废气、废液、固体废弃物。 首先我们来看看——废气： 通常情况下，生物实验室产生的废气相对较少，化学实验室倒是比较多，而且多具有毒性，因...
...行。并从/etc/profile.d目录的配置文件中搜集shell的设置。这个文件一般就是调用/etc/bash.bashrc文件。 /etc/bash.bashrc：系统级的bashrc文件，为每一个运行bash shell的用户执行此文件.当bash shell被打开时,该文件被读取. /etc/environment: 在登...
...示发生非同义替换的位点数量/非同义替换位点数。假设这个基因没有受到自然选择压力，那么根据中性选择理论，密码子同义位点的变化是完全随机的，并随时间推移累积。如果物种发生了全基因组加倍事件，会产生大量的同...
...草莓的转录组数据，这两种草莓的基因注释的ID不一致，这个时候我可以利用blast本地建库来匹配A种草莓与B种草莓的基因吗？也就是X基因在A草莓有一个ID，B草莓有一个ID，利用序列的相似性对应起来ID，再把鉴定到的A草莓的HSP70...
vcftools可以去除或保留vcf文件中的样品，用到的选项为 --indv 和 --remove-indv ，指定要从vcf文件中保留或删除的样品。 可以多次使用此选项来指定多个样品。 具体用法如下： 下图为原始vcf文件。 只保留1和10号两个样品，执...
... 1）新建虚拟机 设置一下虚拟机的名字，放置的路径（这个路径选个磁盘空间大些的盘），系统类型等等 分配内存，注意在绿色的范围分配，最少建议2G，最多建议不超过总内存的一半。 添加硬盘： 选择vbox硬盘vdi建议选...
...全部基因的总称，但由于物种内也存在分化，所以并不是这个物种中所有个体的基因组成都是一样的，所以，泛基因组可分为三个部分：1. 核心基因组（core genome），即在所有个体中都存在的基因，该类基因非常保守；2. 非必须...
...的参数 .mao文件 -d输入的是多序列比对之后的结果文件，可以是fasta格式 -o 是输出路径 其中一个重要的文件 也就是参数.mao文件的获取比较困难，蛋白序列、DNA序列以及建树基于的模型不同，具体的参数变换比较多，而linux下...
...，尤其是阿兹海默症和脑中风，同认知指标呈现负相关。这个结果无疑是令人难以解释的。 这不是结束而是开始 该项目集合了众多研究者的智慧，调查了百万级别的样品数据，也得出了几个颠覆性的结果，然而这仅仅是解开...