文章 NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件等

...色体(线粒体基因组)，记下对应的RefSeq（Scaffold序列号）NC_007897.1                                                     （太长了，省略中间部分）                                                斑胸草雀基因组染色...

文章 盘点：科研学术圈不为人知的行业“黑话”

...类会议上谈笑风生那种。 小牛：正在向大牛奋斗的科研工作者(0.0)。 青椒：就是青年教师，高校教师中压力最大的群体。 独立PI：独立的 Principle Investigator，能够拥有课题组话事权的导师，通常指代青椒在高校担任教职后能够...

问题 泛基因家族-结构分析

老师， 我的泛基因组中，有三个品系的基因组命名有“_”，如图所示。 所以我进行这个操作时那三个品系都被删除了，我应该怎么改一下"s/_/\t/g"|这个命令啊。 #提取基因的位置坐标信息 cat ${svgene}_gene.list|sed "s/_/\t/g"|while ...

文章 在线进化树美化网站-iTQL

...人羡慕的系统进化树图！也有不少在线工具可以实现这项工作，譬如iTQL:http://itol.embl.de/ 进入网站主页之后，选择Upload进入数据上传页面，提交MEGA构建进化树的结果文件nwk. 导入文件nwk，或者直接粘贴nwk文件中的内容到text填...

文章 让AI帮你处理数据，绘制图表！让你强到可怕！

...等人工智能在数据分析领域的奇妙应用，助力我们的科研工作更上一层楼呀！期待在直播间与大家相见哦！

问题 python rpy2 报错

...oft/R/R-v4.0.3/lib64/R/library/methods/libs/methods.so: undefined symbol: R_dot_GenericError: package or namespace load failed for ‘utils’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...): unable to load shared object '/share/work/biosoft/R/R-v4.0.3/lib64/R/library/utils/libs/utils.so':  /share/work/...

文章 某网络小说作者：我要去发篇Nature了，小说停更。。。。

...内的两人在做， 眼看着周围同龄人已经结婚生子、买房工作，而自己还挣扎在没有方向的道路上，内心压力无比沉重。 于是写小说成为了她派遣苦闷的途径，并从中得到了乐趣，恢复了乐观的心态。 并且，在写小说的途中，...

问题 circos 分析

...是错误的日志内容： *** CIRCOS ERROR ***      cwd: /work/cm01_reseq_demo/8.circos      command: /biosoft/miniconda/envs/reseq/bin/circos -conf      /work/cm01_reseq_demo/8.circos/circos.conf -outputdir      /work/cm01_reseq_demo/8.circos -outputfile circos  CONFIGURATIO...

文章 华大stereo-seq 添加上底片转换成10X格式方便scanpy和seurat读入分析

示例数据： https://en.stomics.tech/col1241/index.html 0.SAW流程： saw count \    --id=Demo_Mouse_Brain \    --sn=C04042E3 \    --output ./ \    --omics=transcriptomics \    --kit-version="Stereo-seq T FF V1.3" \    --sequencing-type="PE75_50+100" \    --chip-mask=./C04...

文章 R语言基础入门—R语言概述与安装！

...各样的数据分析技术，几乎可以完成任何类型的数据分析工作，并且R拥有顶尖的绘图功能，可以绘制非常专业精美的图形。3）优秀的绘图功能R语言为统计而生，而我们生物数据分析当中很多地方都需要用到统计分析，所以说掌...

文章 如何有效利用企业资源，发挥Scrum最大优势？

...以往的经验给大家举几个例子： 招聘模式、职位描述、工作汇报架构、激励措施和绩效管理流程会对团队认同感维度产生重大影响。跨部门或跨团队的合作可以提供相当丰富的信息。如果各团队没有想通过合作更好的实现企业...

文章 如何从GWAS结果中获取表型解释率PVE——TASSEL、GEMMA篇

...到pve值的，直接使用数据即可 1.1 GLM模型 marker_Rsq 即R2值，即表型解释率PVE 1.2 MLM模型及CMLM模型 MarkerR2 即R2值，即表型解释率PVE 注意：标记的R2（即表型的解释率），因为做的是单标记检验，每个标记都是独立计算的，...

文章 linux生物信息软件安装管理工具conda使用

...容易的，所以初学者在第一步就放弃了，因为不懂linux的工作原理一旦安装报错就很难解决。那么在linux系统中有么有像360软件管家一样的工具，只要输入软件名然后自动安装呢？答案是有的那就是conda，有很多的生信软件都可以...

问题 老师运行“ls aln_out/*.cds_aln.fasta |while read a;do sed -r 's/([A-Za-z]+_[A-Za-z]+)_.*/\1/g' $a > $a.renamed;done”后得到的结果single_copy.cds_msa.fasta是空的文件夹是空的，但是提取pep序列运行是正确的，这怎么解决呀

文章 pacbio 三代全长转录组数据分析流程 Iso-Seq 3

...列。 ccs test.subreads.bam ccs.bam  --noPolish --minPasses 1  2 测序引物和barcode的去除这一步是采用lima 来完成的，这个软件也是官方最新开发出来的程序，速度和准确度都较以往的算法有了很大的提升。还能够基于barcode序列区分不...