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linux命令直接统计文本种各类型数据频数情况。 譬如有如下数据: ABVAGCGDEFDGRDFGAF 进行排序 sort 之后 uniq -c 即可统计各字符出现的频数 cat test.txt |sort|uniq -c 3 A 1 B 1 C 2 D 1 DF 1 E ...
...Rn.eg.dbRatorg.Ss.eg.dbPigorg.Xl.eg.dbXenopus 相关课程:GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程...
R 中的数据 有时会出现NA(缺失) NaN(不是数) -Inf/Inf (无穷大)的情况 影响计算,检查数据中是否出现这种情况 可以用 is.na 或者is.nan、以及is.finite()或者is.infinite() 进行判断。 数据Data > Data[1] 1 2 3 NA...
1、转录组数据来源: (1)4个发育时期,3个重复(自测)(因为样品量只有4×3=12,单独进行WGCNA结果不太可靠); (2)5个发育时期,3个重复(NCBI); (3)胁迫处理和对照,3个时期,3个重复; 2、表型数据: (1)只有...
请问老师,数据载入的时候出现这样的问题,是为什么?
...对吗,不再做课程中讲的质控/ 3.由于是120个样本,所以数据是120个文件夹名为(W1A-W120A),每个文件夹里面包含了两个测序数据文件-1.fq和-2.fq(如图),读取这一段循环怎么写比较好呢?
TCGA里的数据如何下载?
可以将两者的数据直接按照甲基化探针直接merge嘛,批次效应怎么处理?
老师,我照着视频教程用示例数据作图没问题,但用我自己的数据总是出问题,能不能帮我看一下数据有什么问题。 OTU_count_even_depth50k.txt OTU_count_even_depth50k6.txt 前面这个是原始数据,后面这个是对照示例数据我感觉可能有...
各位大神,现在有没有比较新,能用来快速发文的医学数据库,或者研究方法。发文周期比较短可以用来毕业的
数据分析处理的过程中,绝大部分的科研工作者,都会存在利用数据绘制热图的需求。如果你会编程,利用R、MATLAB 等,完成热图的绘制轻轻松松没烦恼,其次你还可以利用热图绘制软件完成目标,但是你知道怎么利用Excel画热...
...CA GCGTATGALin033 GATCTGCA GTATGCGA 准备测序数据,没有拆分的双端数据放到一个目录:muxed-pe-barcode-in-seq,分别命名为:forward.fastq.gz reverse.fastq.gz 数据导入: qiime tools import --type MultiplexedPairedEndBarcodeInSequence...
...重叠的扇形图呢?可以借助plotrxi包中的fan.plot函数 以dat数据为例: > dat type Num1 A 902 B 343 C 564 D 995 E 15 ggplot2绘制的结果如下图(https://www.omicsclass.com/article/415): 利用fan.plot绘制的扇形图如...