...趋势 scale()函数 scale(x, center = TRUE, scale = TRUE) x一般是一个矩阵,也可以是一个数值向量 center--是否中心化 scale--是否标准化 1、以数值向量为例: > A [1] 3.74149 7.36180 5.81734 5.71131 7.97054 10.37620 6.29949 5.55062 ...
在网上看见有一个笑话是这样的: 1. 程序员写出自认为没有Bug的代码。 2. 软件测试,发现了20个Bug。 3. 程序员修改了10个Bug,并告诉测试组另外10个不是Bug。 4. 测试组发现其中5个改动根本无法工作,同时又发现了15个...
单细胞测序,通俗地来说,就是在单个细胞水平上对基因组、转录组、蛋白质组进行测序分析的技术。传统的转录组测序是对多细胞组织进行的混合测序分析,得到的是一群细胞内的基因表达的均值,由于单个细胞之间存在异质...
...称虚设变量、名义变量或哑变量,用以反映质的属性的一个人工变量,是量化了的自变量,通常取值为0或1。引入虚拟变量可使线形回归模型变得更复杂,但对问题描述更简明,一个方程能达到两个方程的作用,而且接近现实。 ...
...示,这里选择了人的早幼粒细胞白血病细胞系NB4细胞的六个样本数据(GSE2600),分析的输入文件是下载的表达矩阵文件,而分析之前需要确保正确安装和加载limma,同时需要对工作路径进行设置。 library('limma')workdir="F:/GEO/201805...
我基于hifi和ont还有hic进行了基因组组装,挂载后通过ont组装的基因组进行了gap填充,gap从11个变为了7个,但是进行polish后直接没有gap了,这个结果可信吗?
老师好,由于时间等某些原因。先把10个样品的gvcf文件合并了生成一个all.vcf后续分析,然后其他几十个样本的gvcf生成之后,是直接和all.vcf可以合并吗?还是说只能和前10的gvcf合并?
...a可以直接bwa比对吗,不再做课程中讲的质控/ 3.由于是120个样本,所以数据是120个文件夹名为(W1A-W120A),每个文件夹里面包含了两个测序数据文件-1.fq和-2.fq(如图),读取这一段循环怎么写比较好呢?
30岁,是人生的一个重大的节点。 学霸姐姐在小时候畅想未来的时候, 觉得自己30岁应该是家庭美满、儿女双全、事业有成, 现在看来,这个目标,怕是要往后拖很久很久很久了。 大家读博都读了几年? 对于这个问题,学...
再安装R包是遇到以下报错,解决方法记录一下。 这个是GCC版本问题;设置一下用新版本就行了;这个在终端运行;立竿见影。 #module load GCC/7.2.0-2.29 然后: mkdir -p ~/.R echo 'CXX17 = g++ -std=c++17 -fPIC' > ~/.R/Makevars
安装circos时,安装所缺少的模块时,root下所有使用./circos -module模块显示都是ok,但是退出root有四个显示是missing,但用whereis找这个四个模块都能找到,请问是什么原因?
...的情况也同时存在着。 首先,学霸姐姐想问大家一个问题:认错了细胞系会造成什么后果呢? 稍微想一下,就知道后果很严重—— 1、浪费时间和科研经费; 2、实验结果不可重复、科研结果不可靠; 3、...
...状等)突变体。后续对茎色进行突变表型筛选,在M7代1000个品系中,筛选获得30个茎色为紫色的突变体,难道不可以不经过回交,直接将这30个品系分别提取DNA,然后再等量混合进行二代全基因组重测序,从而扣 snp,以定位到基...