...我整理一些大家常问的问题，供大家参考： 1. 需要多少个样本？ 1.1 至少需要15个样本，推荐20个以上的样本。 1.2 样本越少，网络的噪音就越大，样本越多，网络就更加的稳健。 2. 基因是否需要进行筛选？ ...
grep函数的使用： grep (/EXPR/, @array) #其中EXPR表示需要匹配内容的正则表达式，@array表示待匹配的数组，反向匹配使用grep (!/EXPR/,@array) 若使用标量接收返回结果，返回值为匹配的次数，使用数组接收，则返回值为匹配到的数组元...
cp命令目录基本操作 cp命令用来将一个或多个源文件或者目录复制到指定的目的文件或目录。它可以将单个源文件复制成一个指定文件名的具体的文件或一个已经存在的目录下。cp命令还支持同时复制多个文件，当一次复制多个...
老师您好，我用qiime2的双端拆分工具 明明有20个样本 但是拆分完之后只剩10个样本了 如下图 样本的情况是 有一个重复组 一个重复组内有10个样本，重复组内的forward 的 barcode不同 重复组间的 reverse 的barcode不同
...验室有自动洗板机还好，要是手动洗板的小伙伴，一次来个几块甚至十几块板子，拍板那个痛啊，说多了都是泪。 而Elabscience的QuicKey ELISA试剂盒，在常规夹心法试剂盒的基础上，减少了实验操作步骤，仅需两次洗涤、三次孵...
WGCNA样本必须至少15个基因吗？我有三个处理，每个处理三个重复，供9个样本，这样可以做WGCNA吗？这样做出来有意义吗
...snp.refGene.logsnp,refGene.variant functionsnp,refGene,exonic variant这几个大小为0，运行提示如下NOTICE: Running with system command <convert2annovar.pl -includeinfo -allsample -withfreq -format vcf4 /work/my_reseq/4.snp_indel/all.clean.snp.vcf.gz > /work/my_reseq/5.var_ann/snp.a...
在使用linux中的sort命令排序时，免不了有p值是科学计数法的情况 可以使用-g参数来对科学记数法的值进行排序，而且默认是从小到大排序。 以下是其他常用参数：
...的家族基因序列，用于本地blast我的转录组数据，获得62个含结构域的基因。通过CDD-search确定其中46个基因含有完整的结构域，但有16个基因只有部分结构，如图，黄色标记的是含部分结构域的基因。这些基因我怎么取舍呢？ ...
...保留账号，可以指定UID，例：useradd –u 600 user3 2、使用 passwd 命令为新建用户设置密码 例：passwd user1注意：没有设置密码的用户不能使用。 3、命令 usermod 修改用户账户 例：将用户 user1的登录名改为 u1， usermod –l u1 user1 1 ...
...件提取序列 seqkit subseq -r 1:12 x.fasta #提取每条序列的前12个核苷酸 fastq到fasta的格式转换： seqkit fq2fa x.fq.gz -o x.fa.gz 以及建索引： seqkit faidx x.fa 查看fq文件： seqkit seq x.fq.gz 序列位点突变 seqkit mutate -p -1:x --quiet x.fasta #突变每...
运行代码 Rscript $scripts/cell_trajectory_monocle2.r -g mycelltype \ -i subset.Mesophyll.qs -p monocle2 \ --order.gene.select.method monocle --heatmap.gene 20 \ --heatmap.clusters 4 出现killed，代码运行不了