...进行预处理，标准化之后，获取的结果时一个EList对象，这个对象中包含了探针和基因之间的对应关系，先对芯片中重复的探针检测值取均值之后（https://www.omicsclass.com/article/629），获取的还是一个EList（此处用averEList向量表示取...
...库，它集成了很多蛋白结构预测和功能分析的工具，比如可以预测蛋白的一些二级结构：跨膜区（Transmembrane segments）、复合螺旋区（coiled coil regions）、信号肽（Signal peptides）、蛋白结构域（PFAM domains）等 。 进入SMART主页，...
...用叶绿体基因做系统发育分析。 于已测序的物种，我们可以直接下载基因组数据；而没有测序的物种就需要转录组分析数据了。通常是多个物种一起进行分析的。以转录组数据为例，其步骤如下： 首先是选择用于分析的基因...
...门昂贵的技术，但是已经有大牛在《SCIENCE》上预测，GWAS可以用于研究人类复杂疾病[1]。再后来随着高通量测序技术的发展，动植物领域利用GWAS进行数量性状基因定位也开始盛行。 到现在为止，动植物的GWAS已经发表了若干篇...
...t()所得环境变量拟合结果的显著性将会非常理想。那么，这个显著性能否说明什么问题吗？不，它没有任何意义。 以下使用3个示例，以展示为什么不能使用envfit()检验约束轴中解释变量的显著性。这里生成了一组随机变量，将...
...ic Investigation of Communities byReconstruction of Unobserved States”，可以通过16S rRNA基因序列，预测对应的细菌和古菌的代谢功能谱。 有了PICRUSt，相当于在菌群的“组成”和“功能”之间搭起了一座桥，即使只有16S rRNA基因的测序结果，...
...d on）分别是档案系统及其挂入点。我们可以看到 /dev/sda1 这个分割区被挂在根目录下。 接下来的四个字段 Size、Used、Avail、及 Use% 分别是该分割区的容量、已使用的大小、剩下的大小、及使用的百分比。 FreeBSD下，当硬盘...
...名声大噪，并且引发了整个欧洲模仿维特自杀的风潮。 这个效应也被称为——“维特效应”。 在上述的那篇文章中，研究人员调查研究了1993年—2013年之间，跟韩国10位名人自杀事件有关联的模仿自杀事件， 并且针对不同的...