...ead(lncRNA) lncRNA1 lncRNA2 lncRNA3 lncRNA4 lncRNA5 sam1 7.80 5.81 6.40 6.11 4.87 sam2 1.47 1.75 2.49 2.20 2.02 sam3 0.00 0.00 1.28 0.00 0.00 sam4 0.00 0.00 1.74 0.00 0.00 sam5 1.83 0.99 0.72 0.69 0.50 sam6 0.00 4....
...中位生存期算出来的,但要如何表达你这个cutoff值是如何筛选出来的,我只听懂你说根据最大化延长中位生存期来生成的,但这个专业一点咋说
已解决
...蛋白序列,基因id和蛋白id好像没有对应关系,,,这是已提取的AT.gff文件转录本名称都是下面这样的。。。新人刚接触这个,麻烦老师了!可以通过修改get_fa_by_id.pl的脚本解决吗?
...在用Qiime2做16S V3-V4的分析,是直接拿到公司的测序数据,已拆分但未去接头。我去接头序列后用dada2做了去噪,原本10万 reads/sample在去嵌合体后一下子降到1万左右,前序步骤merged reads还有一半以上(如下图)。且能得到357个特征...
...支持联targetscan, miRDB,miRTarBase等数据库或软件进行一定的筛选。 3. 离线预测 miRWalk 除了能够在网站上进行少量的miRNA和基因的预测,也可以将整个的数据库下载下来,在本地的机器上进行预测,这样比较方便对批量的miRNA和靶...
...029的cor,而红色模块是0.23。我后面要根据GS>0.2和MM》0.8筛选hub gene,然后做后续分析。黑色的模块还能用来分析吗,是不是要舍弃掉。它的cor实在是低,并且P值>0.05。红色模块是不是还可以继续分析。
老师您好,我所研究的基因家族通过PFAM和HMMER筛选出187个符合条件,但是将其fasta文件提交至SMART在线数据库有多达42个是no match,请问那是把找不到的删除掉吗?还有就是我所选择的基因家族包括两个亚族,两个亚族下面有分为1...
用NB-ARC.hmm搜索拟南芥的蛋白质保守结构域时,运行显示fatal exception(source file fwdback.c, line 459);foeward score is NaN。再次运行显示segmentation fault。麻烦老师看看是什么问题,非常感谢!!
...释,但是在参考书里没有找到这个词或相关章节。 通过搜索找到了: 1.分子连接性:指一个分子中各个骨架原子排列或连接的方式,它反映了分子结构的信息。分子连续性是研究分子结构和理化性质与生物活性之间定最关系(...
...将单个源文件复制成一个指定文件名的具体的文件或一个已经存在的目录下。cp命令还支持同时复制多个文件,当一次复制多个文件时,目标文件参数必须是一个已经存在的目录,否则将出现错误。 语法cp(选项)(参数)选项-a:此...
...的不同阶段和领域,主要包括化学结构分析、化合物活性筛选、药理学、药代动力学(吸收、分布、代谢、排泄)、毒理学、药物配方、药物基因组学、药物安全性评价、至期临床试验的设计、研究人员和实验单位的选择、监督...
...comine也是肿瘤领域中一个经典的样本数据库,能帮助我们筛选一些值得研究的靶分子,或预测表型。为什么说“也”呢?因为它和咱们之前讨论过的TCGA一样,都是肿瘤领域应用较广的数据库。 不过Oncomine和TCGA相比的优势就是...
...还好,昨天Boss安利了一个python脚本,能够快速的从NCBI上搜索并下载所需的序列,再也不用这么费劲啦!今天呢小编就赶紧来跟大家分享一下,希望可以也能帮到大家! NCBI批量搜索、下载序列 脚本代码: from Bio import Entrezimpor...
...基因ID(leaf)位置错乱,没有对齐。 这时候需要去百度搜索所需要的字体,然后下载到本地,一般下载的字体包中有一个.tff结尾的文件。双击文件,然后再点击安装: 之后在AI菜单栏中,“文字”->“字体”中就有我们...