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文章 iTOL 导出PDF,SVG,EPS的进化树图片有细线解决办法

...细线了; 其他依次类推,最终结果图: 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 按物种拆分blast本地库

NCBI的nr、nt库包含了基本上所有现有已知物种的序列信息,在进行blast时,由于数据库较大,搜索时间会比较长,同时可能会有其他物种信息干扰。因此我们可以根据NCBI提供的物种分类号对其进行拆分,下面以nr库进行举例说明...

文章 CDS、ORF、cDNA、mRNA、外显子、内含子等区别与联系

... 我们常说的“基因”严格来讲是指:负载特定生物遗传信息,能够产生一条多肽链或功能RNA所必需的DNA分子片段,不但包括编码区,还包括5'-端和3'-端两侧特异性序列,虽然这些序列不编码氨基酸,但在基因表达的过程中起着...

问题 R语言获取GSE数据集warning

最初提取时没有此警示信息,如今矩阵列名全部丢失,请问老师,这是为什么呢?

文章 SCI期刊选择困难症有治了!推荐一款选刊神器!速领!

...还可以继续修改筛选参数;再下方是筛选出的期刊列表,信息也很直观。 点击具体期刊可以进一步查看该期刊信息,如下图,展示信息很是丰富,像引用指数、影响因子、接收比例、审稿/出版周期、版面费等,另外在页面右上...

问题 swissport功能注释

...整条contig拿出来做nr注释,就得没有该叶绿体基因的注释信息(见下图3)。那么,该怎么合理的解释这种现象呢?

问题 重测序课程中批量设计引物,脚本问题

老师你好,在使用重测序批量使用脚本的过程中,出现这个问题们应该怎么解决 使用第一个脚本 下面的是报错信息

文章 tcga_gene_exp_download.r TCGA数据下载脚本使用说明。

...gene symbol,重复的gene symbol 随机取一个作为代表; 样本信息文件: 基因ID对应信息文件:

文章 转录组比对软件HISAT2的使用说明

... 和 metrics  (1)   --no-head          在SAM文件中不输出head信息   --no-sq            在SAM文件中不输出head的@SQ 信息   --rg-id <text>     设置reads ID信息   --rg <text>        增加reads 分组信息                --omit-sec-s...

文章 sed使用

...达式。-v: 增加输出的详细程度,例如在处理时显示脚本信息。--quiet 或 -silent: 等同于-n选项,仅打印处理后的行。--verbose: 等同于-v选项,提供详细的处理信息。--version: 显示sed的版本信息。-h 或 --help: 显示帮助信息。 [脚本]:具...

问题 采用RSeQC 对bam 文件进行质控分析时,用inner_distance.py报错。

... 对bam 文件进行质控分析时,用inner_distance.py报错。 报错信息: manager@bl8vbox[QC] inner_distance.py -i /home/manager/rnaseq/work/3.alignments/hisat2/UHR.bam    -r stringtie_merged.bed  -o UHR_inner_size Traceback (most recent call last):   File "/usr/local/bin/inner_dis...

文章 GoMapman-几种模式植物蛋白、代谢物、sRNA关于Mapman注释查询

...关课程推荐:转录组标准分析后的数据挖掘 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解...

文章 Mapman对表达数据进行聚类分析

...程推荐:转录组标准分析后的数据挖掘 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数...

文章 avereps相同ID取均值(limma包函数)

...课程:GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理解不...

文章 基因别名alias转换成官方symbol

...:GEO芯片数据挖掘、GEO芯片数据标准化 更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接:基因家族分析实操课程、基因家族文献思路解读 2. 转录组数据理...