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文章 超大基因组,超长染色体,凤丹牡丹基因组怎一个难字了得!

...体挂载以及基因组注释。目前前三部分内容录制完成,剩余第四部分基因组注释的章节预计12月中旬更新完毕,购课程学员,课程更新后不用复购,可直接学习新增内容。扫描下方二维码开始学习吧! 注:1. 本系列课程为...

文章 GEO 数据介绍及在线下载

...库的GSE数据编号,通过这个编号我们就可以在GEO数据库中搜索相应的GSE编号,然后下载数据了,例如: 如果不知道编号通过直接搜索下载,可参考:https://www.omicsclass.com/article/1101 然后就可以得到相应的数据信息: GEO数据...

问题 代码使用不清楚

546就是没有经过筛选的,所以我是不是把下面的的代码用错了? 我不知道下面的代码使用在哪一步,并且不清楚有什么要修改的地方?

问题 WGCNA表达基因

老师,您好,我用GEO数据库的表达矩阵做WGCNA分析,总共34个样,表达矩阵中有60000多个基因,基因太多,如何进行筛选?WGCNA是否有处理这样大量数据的方法?

文章 linux中进程状态

...不可运行, 进程必须等待直到有中断发生)   4. 僵死(进程终止, 但进程描述符存在, 直到父进程调用wait4()系统调用后释放)   5. 停止(进程收到SIGSTOP, SIGSTP, SIGTIN, SIGTOU信号后停止运行运行)   ps工具标识进程的5种状态码:  D ...

文章 linux下samtools安装指南

...安装。 首先查看curses相关的安装包: yum search curses 搜索结果如下图所示: 找到这个安装文件ncurses-devel.x86_64,安装即可: yum -y install ncurses-devel.x86_64 htslib包安装 再之后需要安装htslib包。 下载: mkdir /biosoft/htslibcd ...

问题 W11系统开启hyper-V失败无法解决怎么办?

您好,电脑是联想Thinkbook,W11系统,未进行任何操作前电脑显示虚拟化开启,但是我后续勾选hyper-V,开始过程中一直失败,为什么呀?

问题 TCGA的甲基化矩阵,是否需要使用normalizeBetweenArrays标准化处理?

老师您好,我从数据库下载了TCGA的 Methylation 450芯片数据,取得基因的甲基化矩阵。请问矩阵数据可以直接使用了,还是需要先进行芯片间标准化处理?

文章 Linux下载数据

1. 查看Linux是否安装linuxnd软件 下载及安装linuxnd软件:http://data-deliver.novogene.com/download 2. 登录 $/share/work/biosoft/nuohe/linuxnd/lnd login -u 用户名 -p 密码 3. 查看目录 $/share/work/biosoft/nuohe/linuxnd/lnd list    #list用户根目录$/share/wo...

文章 三代转录组,当前你不可忽视的研究手段

...有25条Isoforms与咖啡因合成基因同源性很高,经过进一步筛选10条Isoforms被认定为候选咖啡因合成基因,包括3个XMT1的变异体,MXMT1的1个,DXMT1的2个,DXMT2的3个变异体。 这10个基因囊括了除XMT2 外的负责合成咖啡因的所有基因。与...

文章 NCBI、ENA高通量测序数据下载-fastq数据

...数据下载 打开ncbi官网(https://www.ncbi.nlm.nih.gov),点击搜索project号 PRJEB19900。 点击"22",项目有22个样本: 再随机点击一个 之后点击,All run,就可以看到这个project下所有样本的数据; 来到所有样本的数据信息页面,...

文章 SCI文章绘图及数据统计暑期班

...处理数据(求和,平均值,汇总等等)对数据进行转换,筛选,方便后续分析T检验,及可视化 超强的数据可视化能力:R语言绘图能力数据可视化,一定会给你的科研论文增色。 培训优势: 1.内容适中,时间充裕,学练结合...

问题 老师您好,我在用conet对自己数据分析时,总是报错。

我所用数据是在组学大讲堂课程中参考数据的基础上,把自己数据粘贴进去。随后按步骤操作时,软件conet总是报错,无法构建OTU网络图。报错图片我上传,恳请老师相助。

问题 结合转录组分析基因家族

老师,您好,我下载了别人发表的转录组数据,想拿结合做热图,但是文件太大,有十几个G,这样的文件该怎么打开筛选表达量数据呢

文章 docker在windows系统和mac系统中安装

...个独立的密码,左侧的加速器帮助页面就会显示为你独立分配的加速地址。 对于使用 Windows 10 的系统,在系统右下角托盘 Docker 图标内右键菜单选择 Settings,打开配置窗口后左侧导航菜单选择 Daemon。在 Registrymirrors 一栏中填写...