文章 PlantPAN数据库

...Download 下载分析结果 2. 分析结果详细如下：分为匹配搜索结果，CPG岛，串联重复，以及可视化选项。在匹配搜索结果中，可点击显示的转录因子矩阵文件ID，就会在上面文本中显示出来，ID 后有标注 CPG岛则说明这个位点与它...

问题 第一张图片为smart，没有查询到结构域。第二张图片为interpro，共有135条序列，最后显示结果为118。图3为CDsearch查询结果，为135条。最终形成的新的IDlist是不是以interpro为准，118个ID

问题 我用MCScan跑的染色体共线性图结果中，只显示出两条染色体，大部分用一个数线表示是什么意思呢，求救大神~~

问题 老师，您好，小麦基因组顺式元件分析，染色体拆分和加内存以后结果还是显示内存不够，这时候该怎么办呢？复杂一点的方法也没有关系

文章 在线进化树美化网站-iTQL

...化树的提交 完成进化树提交之后，会跳转进入具体的显示界面，并可以开始对进化树进行显示调整和美化操作。各项显示的操作主要在右侧Controls面板进行，包括基础(basic)的进化树显示性状、标签字体大小、枝长、角度等等...

问题 老师，为什么pav分析结果是这样，上面显示我的基因编号到99了是为什么啊，没有这么多基因呀，我做出来一个基因组平均才十几个

图太大了放在评论里了

问题 老师您好，急切请求帮助！MENA分子生态网络分析时，上传200个OTU节点，但是最后显示nodes为383 （其中一部分不包括上传的节点），请问这样的结果合理吗？怎么解释

问题 老师您好，我按照课程提取NAC基因家族成员的domain序列后，MEGA比对显示没有找到共同的位点，没办法做进化树。用TBtools进行快速修剪后依然不行。我就用CDD去验证成员的domain序列，结果显示我的domain序列提取应该是没问题的。不知道这是由什么引起的呢，麻烦老师解答一下。

文章 awk 判断并筛选数据

... ($7>5) print}' A|less ###筛选A文件中第七列大于5的数据，显示所有符合的结果 awk '{if ($6>5 && $7>5) print}' A|less ###筛选A文件中第六列和七列都大于5的数据，显示所有符合的结果 awk '{if ($6>5 || $7>5) print}' A|less ###筛...

问题 样品聚类树图片不显示

在学习WGCNA的时候，进行到样品聚类树部分时，并没有像教程视频一样出现图片，生成的PDF也是空的，无法打开，想问一下这样的问题如何解决。 这是教程代码运行结果： 这是我电脑上的运行结果： 生成的pdf文件是0k并且无...

文章 R markdown 常用设置

...赖于相同的代码，可以用这样的方法。 6.echo = TRUE 同时显示代码块 + 结果。echo = FALSE 不显示代码块，但显示结果。禁止代码出现在最终报告中，但不会禁止结果。为不想看到 R 代码的人 们编写报告时，就可以使用这个选项。 7...

问题 老师您好，请求帮助！MENA分子生态网络分析时，上传200个OTU节点，但是最后显示nodes为383 （其中一部分不包括上传的节点），请问这样的结果合理吗？为什么会出现这样的情况呢

问题 老师您好，我想请问一下我用GSDS做顺式作用元件图时，提交结果只显示CDS的长度，并没有顺式作用元件，查看了基因ID也是对应的，且提交的时候并没有提示文件格式有误。请问这个情况如何解决

问题 请教老师，用自己的hmm文件，进行了domain的二次搜索，结果如下图所示。结果显示仍然会有很多只是匹配了一部分序列片段。我用这些部分比对上的结果截取序列后，再三大数据库对比发现也存在我想要的domain. 现在的问题是，如果要这些部分的结果截取序列，做进化树就会差异太大。如果不要部分比对上的，又怕少了家族序列。这样的情况如何处理，有没有相关的标准？谢谢

问题 在提取1500bp序列做顺式作用元件检测时，使用tiquxulie.pl这个脚本，开始时显示out of memory，我把虚拟内存提高到了4G，显示zsh：killed,得到的结果还是空的，请问老师这个问题怎么解决呢？

谢谢老师。