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文章 转录组结果解读及分析技巧

...已超1000份，解决转录组结果“是什么”的问题。 针对“怎么做”的问题，我们根据上千个项目经验，总结了8个最常用的后续个性化挖掘方法，制作了《转录组标准分析后的数据挖掘》，讲述的方法大部分可在Windows下操作，无...

问题 我再ITOL上传了进化树文件，为什么总显示图片的结果，不知道是nwk文件出了什么问题

我再evolview中也上传了这个文件，总是加载不出来，一直在这个界面，里面是你什么原因呢？

问题 基因家族表达量热图的时候没有找到合适的FPKM文件

       老师您好，我在做基因家族表达量热图的时候没有找到合适的FPKM文件。我做的物种是草莓A种的HSP70基因家族，数据库上有B种草莓的转录组数据，这两种草莓的基因注释的ID不一致，这个时候我可以利用blast本地建库来匹...

问题 用GenotypeGVCFs合并不同种质的g.vcf文件

在用GenotypeGVCFs合并不同种质的g.vcf文件时，用这样的命令（gatk  --java-options "-Xmx50g" GenotypeGVCFs --tmp-dir $tmpdir -R $REF -O all.raw1.vcf.gz -V gendb://db ）。但是我发现生成的 all.raw1.vcf.gz文件中，最前边的不是Chr1。而是Ch4（第四条染色体，...

文章 2020考研340万人：研究生毕业这么难，你们为啥还要考研?

...秘密： 距离2020年研究生考试只剩26天了。。。 而你还在刷手机。。。 据数据推测，2020考研将难到吓人! 2019年考研人数是290万，增幅21.8%， 根据这一数据，有网友推断2020年考研人数将增至340万，比2019年多50万人， 考研...

问题 Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

请问您这个谷值问题怎么解决的

问题 带编制！招聘博后、讲师、副教授。福建农林大学转录系统生物学课题组招聘

...组公开发表，然而除编码蛋白质的基因外，基因组中还存在大量”暗物质”——非编码调控元件，其功能有待系统解读。本实验室围绕真核生物中两类主要DNA结合蛋白（转录因子与核小体）的生化互作、生理功能开展研究，解析...

问题 老师你好。请问共享目录挂载不成功，重装也一样，而且vbox屏幕不能全屏，no such device

图二为导入贵公司的linux后，打开设置的共享文件夹时，预置的两个共享文件夹。但在电脑中没有查询到，我就把它删了。重新创建了共享文件夹。不删而启动Linux将出现图三

问题 老师您好，我在做mcscanx共线性分析基因家族加倍实操课程时，安装mcscanx报错

...gt;。 但是又出现了另一种报错，能麻烦老师看一下嘛 在终端输入java后

文章 win10装docker desktop提示Installation failed: Containers Windows Feature is not available

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. NCBI数据上传

文章 GO富集分析统计表中差异基因数量不一致

在转录组差异基因分析中GO富集分析这一步，有两个表格统计的差异基因数量不一致，如下图所示： A_vs_B.GO_ann.stat.xls文件： A_vs_B_GO_enrich.xls 同是extracellular region，差异基因的数量却不相同，这是由于两个表统计的方法不太...

文章 SCTransform ,Error: useNames = NA is defunct

SCTransform在seuratv4的时候没问题,升级到v5的时候不工作,出现报错 > brain <- SCTransform(rep, assay = "Spatial", verbose = TRUE)Running SCTransform on assay: SpatialRunning SCTransform on layer: countsvst.flavor='v2' set. Using model with fixed slope and excluding poisson ge...

问题 请问这2个sam文件对后续有什么帮助吗 占用内存太大 想删掉 不知道有没有用

感觉后面的代码都是基于绿色框框的2个文件在做分析  那红色框内的2个.sam文件有啥用吗？占用存储有点大 可以删掉这2个吗  在跑后续的k2物种注释、蛋白质预测、KEGG注释等分析之前

问题 使用allhic挂载染色体时，长度排序前十的超长contig只有一个挂载到group中，如何将这些未挂载的超长contig也绘制到heatmap图中

...p中，其他超长contig并未挂载。 hic的数据质量不是太好，怎么能将其他超长contig也绘制到heatmap图中，看一下是组装错误还是挂载出错？ 谢谢！

文章 plotrix包画扇形图

...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...