问题 运行docker时出现了以下错误（The system cannot find the file specified... ，重装了一遍）

第一遍装时应该是正常的，重装之后出现了以下错误，怎么破？

问题 运行docker时出现了以下错误（The system cannot find the file specified... ，重装了一遍）

第一遍装时应该是正常的，重装之后出现了以下错误，怎么破？

文章 AttributeError: 'LayoutLine' object has no attribute 'color'

...tList.json12:29:40 [__init__] backend agg version v2.212:29:40 [base] Load file `mcscan_layout`12:29:40 [base] Load file `HVI.bed`12:29:41 [base] Load file `OSI.bed`Traceback (most recent call last):  File "/biosoft/miniconda/miniconda2/lib/python2.7/runpy.py", line 174, in _run_module_as_main   ...

问题 你好，我遇到了和你一样的问题，Circos could not find the configuration file，你解决了吗？谢谢

问题 老师您好，我在使用mRNA_to_geneid.pl脚本提取自己样本基因组gff文件时报错了，请问我要怎么修改这个脚本才能解决问题呀？

报错信息：我的gff文件信息

文章 TCGAbiolinks 错误 Error in value[[3L]](cond) : GDC server down, try to use this package later

...时候会出现“Error in value[[3L]](cond) :    GDC server down, try to use this package later”的错误。 这个错误一般不会出现，除非GDC的网站有问题，检测方法有两种： 1.  在R中运行如下命令： > GenomicDataCommons::status() Error in curl::curl_fetc...

问题 运行perl script/mRNAid_to_geneid.pl PigeonPea_V5.0.gene.gff mRNA2geneID.txt出现以下错误

问题 安装docker toolbox 报错：Looks like something went wrong in step ´Looking for vboxmanage.exe´… Press any key to continue…

win10家庭版，CPU虚拟化已经开启。

问题 TCGA的RNA-seq count annotation过滤，有些不知道是否需要删除

...omic contamination, or low alignment rate) are well below average for this file, which should be used with caution, if at all, for expression analysis. However, other analyses, e.g. mutation and structural variant calling, may still give reliable result. 4. aliquot_annotation_updated：Annotation ...

文章 edger_analysis.r 差异基因分析edgeR

...r_analysis.r -h usage: /work/my_stad_immu/scripts/edger_analysis.r [-h] -i filepath -m filepath -t treatname --control CONTROL --case CASE [-f fdr]...

文章 用Perl一次性读入文件全部内容

...一行读入文件的方法大家都很清楚，可以使用 $line=<FILE>;   #读入一行 或者 @lines=<FILE>;   #把每行读入到一个数组中。 可以通过重定义分隔符$/来完成一次性读入： open FILE,"1.txt" or die $!;{        local $/=undef;   #/...

文章 MarkDuplicates (GATK)报错：打开的文件句柄过多(Too many open files)

...reads=2 -XX:ParallelGCThreads=2 -Djava.io.tmpdir=xxx  MarkDuplicates -MAX_FILE_HANDLES 2800 -I bam -O bam -M metrics 然后就可以正常运行啦。

文章 NCBI下载SRR并转换为fastq文件

...SRR6382584-2.fastq.gz 拆分文件时有两种常用的参数，--split-files 和--split-3： --split-spot: 将双端测序分为两份,但是都放在同一个文件中 --split-files: 将双端测序分为两份,放在不同的文件,但是对于一方有而一方没有的reads直接丢弃 --...

问题 不能启动虚拟机：虚拟机：不能为虚拟电脑 xxx 打开一个新任务. Failed to load VMMR0.r0 (VERR_SUPLIB_PATH_NOT_CLEAN).

问题 Warning message: package(s) not installed when version(s) same as current; use `force = TRUE` to re-install: 'Biobase'

如何解决