我按照 《基因家族鉴定分析手册》 上的步骤操作，在hmmsearch那一步出的结果不行。 然后就准备走blast的流程。 我想问一下blast比对的结果是可以直接进入到下一步的进化树构建，还是要像w.sh文件里面一样用脚本对文件进行筛选...
...Univar <- ldply(Univar, data.frame) 得不到结果。 请各位老师和同学指点迷津，十分感谢！
...习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入...
老师就是这个阈值计算，您的R里面需要提供3个参数，能否指导下这三个参数分别是什么呢？或者有没有示例数据和代码呢？这个我研究了好久都没搞懂 谢谢老师！
老师 你好 我在mirdeep2中也遇到了这个问题 在github中详细看了问题 重新把基因组bowtie后 运行 依然出现了上述的问题 请问你有什么好的解决办法吗 谢谢
...发的软件工具，用于从 SRA (Sequence Read Archive) 数据库下载和处理生物序列数据。 在首次使用该工具包中的fasterq-dump将srr转换成fastq格式的文件时，出现了如下提示信息： 这提示需要进行配置。可以使用vdb-config –interactive通过...
...，学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程6. 生物信息入门到...
由于人类基因组当中有确定可靠的indel位置信息，所以在以前，人类中Call SNP的时候都会用到IndelRealigner，但是最近GATK官网说明如果用最新的HaplotypeCaller or MuTect2 Call SNP的时候就不必再用这种方法处理bam文件，链接地址及说明如...
...t;1 1. 2. 3.以及readxl包的read_excel()函数读xls和xlsxread_excel("data.xls",sheet = 1)# A tibble: 1 x 3 A B C <dbl> <dbl> <dbl>1 1. 2. 3.read_excel("Cici.xlsx",sheet = 2)# A tibble: 1 x...
...随机结合到flowcell中oligo上的，flowcell顾名思义就是有液体在里面流来流去，那么没有结合到flowcell上的DNA片段就会被溶液冲走，如果两个片段结合的位置挨得太近影响荧光信号的识别，计算机会自动去掉这两个点，以保证测序质...
老师好，在参照转录组分析后数据挖掘课程里介绍的利用Heatmapper在线网站绘制基因ID时，热图右侧只显示数字1，2，3，不显示基因ID，但是Excel表格中，已经按照第一行样本名称，第一列基因ID名的格式整理了，请问如何解决这个...
... 2.txt 而"-name"参数后仅能接一个文件，因此正确书写时应在待查找的文件名两侧加单或双引号： find ./ -name "*txt" 此外当前目录中如果包含子目录，可以通过"-maxdepth"参数设置最大搜索目录深度，例如在当前文件夹下二级目录中...
...value值是选取的小于0.001，我这个出来的结果最小都3e-10，怎么设置能让筛选条件（E-value）变小，从而晒出更多 的基因？
...包括子目录） ls -lR | grep "^d" | wc -l 结果为2，目录1和目录1下面的目录B 4、统计当前文件夹下叫某某的文件的数量(包括子文件夹) find . -name filename | wc -l 5、统计当前文件夹下指定类型的文件的数量 例如这里需要找 t...
...学习链接：WGCNA-加权基因共表达网络分析 4. 转录组数据怎么挖掘？学习链接：转录组标准分析后的数据挖掘、转录组文献解读 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读、OTU网络图绘制、cytoscape与网络图绘制课程 6. 生物信息入门...