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问题 Rstudio读不出文件中的数据

...能够读出dim(FPKM)和names(FPKM)。但是datExpr0命令之后是显示一串空白之后,显示omitted 30 rows(即全部数据都没读出来)。我是把excel表格中的所有数据复制,直接粘贴到新建的txt文件中的,然后再Rstudio中读取txt文件。 下图是...

问题 老师,我在用GSDS绘制顺势原件作用图的时候,只显示一部分基因的顺式作用元件,另一部分只有CDS。我试过单独贴每一个基因,是可以的。这种情况该怎么办?(ID检查过了,也更换浏览器,都不行)

文章 GEO数据库挖掘—WGCNA鉴定骨肉瘤转移相关基因

...该模块内上调基因83,下调基因59,进行功能注释的结果显示这些基因涉及的胰岛素样生长因子结合等功能可能和癌细胞转移进程有关。 4.SVM验证和评估 采用支持向量机(SVM)进行数据验证。基于GSE14359筛选分析获得142个基因...

文章 你了解SAM和BAM文件吗

...列的名称,如基因组的染色体编号等,如果没有比对上则显示为*; 4. POS:表示比对的起始位置,以1开始计数,如果没有比对上则显示为0; 5. MAPQ:比对质量;(数字越大,特异性越高) 6. CIGAR:字符串,即比对的详细情况...

文章 如何计算蛋白序列的长度、分子量、等电点等信息

...: 提交后,系统会计算蛋白质序列的各种理化参数并显示出来,而我们需要的信息如下图所示: perl脚本批量计算 ProtParam 网站一次只能提交一条序列,如果我们的蛋白质序列较少还可以使用,但是序列多的话就不适用了。...

问题 为什么docker下载不了第三方镜像?显示这样Using default tag: latest What's next: View a summary of image vulnerabilities and recommendations → docker scout quickview biocontainers/samtools Error response from daemo

问题 不好啥意思打扰了,我在服务器上用ClustalW对2000个基因进行比对,想看一下基因多态性,但是比对了很久,显示第5次跑数据了,是出了什么问题吗?比对完成后如何把非此基因的冗余序列去除,并进行可视化呢

问题 老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,过程中总是显示:WARN Strand BiasBySample - Annotation will not be calculated,genotype is not called or alleleLikelihoodMap is null 属于正常现象么?而且,运行这样一个样本数据真菌的,参考基因组为32.2Mb大概需要运行多久呢?

老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,过程中总是显示:WARN Strand BiasBySample - Annotation will not be calculated,genotype is not called or alleleLikelihoodMap is null 属于正常现象么?而且,运行这样一个样本数据真菌的,参考基因组为32.2Mb大...

文章 蛋白序列亚细胞定位 WoLF PSORT

...图 | 轻松搞定Krona图 | 进化树+基因结构+motif—1张图全显示| 基因组间共线性图 | 多方法、多版本的微生物网络图绘制课程 | 热图竟然还能用Excel来画 | Cytoscape-网络图绘图技巧 | 怎么做一张好看的分类学树状图 |

文章 diff比较两个文件的内容

...你可以使用 diff 命令来比较两个文件的内容。diff 命令会显示文件之间的差异。下面是 diff 命令的基本用法: diff file1.txt file2.txt 这将比较 file1.txt 和 file2.txt 两个文件的内容,并显示它们之间的差异。如果文件相同,diff 命令...

问题 采用你们课程的:Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后,Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆(如下图),请问如何修复(就是修改可视化Manhattan图的纵坐标)

文章 HPA:人类蛋白图谱数据库

...seq)数据,以及内部生成的免疫组织化学染色组织切片,显示相应的空间蛋白表达模式。     以blood & immune cell为例      3.    PATHOLOGY ATLAS 提供了基因在肿瘤组织中的表达情况,以及生存分析,病理学图像等结果。 4. ...

问题 circos画图问题

有哪位老师知道circos该修改config文件的哪个参数可以让背景全部显示呢?现在生成的png图片只显示了方框里的内容

文章 HKT 基因家族分析-家族成员只有个位数10个以内该如何发文

...有相似的序列结构和保守性特征。HKT基因表达和功能验证显示出植物生长发育在盐胁迫下两种截然不同的表达模式,符合了HKT在植物体内两种不同的调控功能的生物学功能的观点。进而通过比较基因组学的方法,深入研究了HKT基...

文章 win7使用“远程桌面连接”连接到另一台计算机

...键入要添加的用户的名称,然后单击“确定”。该名称将显示在“远程桌面用户”对话框中的用户列表中。单击“确定”,然后再次单击“确定”。 注意你无法连接到处于睡眠或休眠状态的计算机,因此,请确保远程计算机上...