利用hummer搜索之后得到相应的序列，在构建进化树过程中，出现以下问题： （1）（2）如何删除序列差异较大的gap，若有，请给予详细的步骤
...个独立的密码，左侧的加速器帮助页面就会显示为你独立分配的加速地址。修改配置文件： vim /etc/docker/daemon.json #大括号{}中添加镜像地址：{ "registry-mirrors":["https://koq0g34v.mirror.aliyuncs.com"]} 然后重启docker，生效 systemctl d...
... https://gdc.cancer.gov/access-data/gdc-data-transfer-tool 2. GDC网站筛选下载的数据 通过GDC 网站上筛选需要下载的数据，形成Manifest文件，将该文件下载下来。这个文件只是记录需要下载文件的名称，需要采用GDC Data Transfer Tool 才能下载...
...地分类，处理，质量检验和存储。分析物在BCR被等分并且分配等分条形码，之后送到其它中心。 BCR缩写对照表：https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables/bcr-batch-codesGCC基因组鉴定中心，在这里用高通量技术来分析癌症基...
...于后续的分析使用。 除了上述方法外，我们还可以直接搜索关键词，比如癌症全称等，并指定数据类型，也可以快速地搜索到我们想要的数据。 选择好后点击进入，就可以看到数据相关的信息。 点击右下角的Open in DCC Data Re...
...NA和27个差异miRNA。已有全部circRNA与miRNA的互作关系。通过筛选，得到64个差异circRNA和23个差异miRNA及其互作关系。 2. ceRNA调控机制：lncRNA与miRNA的互作 通过分析得到17个差异lncRNA和27个差异miRNA。已有全部lncRNA与miRNA的互作关系。...
鉴定得到的motif和已知该基因家族的motif一致性较低，或者说含有更多未知的motif，已经多次调试motif的长度和搜索范围，但是还是一致性较低这是为什么呢？是和物种有关吗？
...导临床治疗和改善胃癌的预后成为迫切的需要。 signature筛选与模型构建分析流程 数据：TCGA数据库中的胃癌基因表达数据（375个样本），由 UCSC Xena 网站下载得到用于预测模型构建；GEO数据库中 GSE62254 and GSE29274数据集用于模型...
在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错： [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed, 重试 1/3 [1] 准备上传: /share/nas1/bam [1] 上...
...都可以： 进入下面的这个界面，有不同组装完整的筛选，系统会自动为我们筛选比较好的基因组，一般来说我们选择level这一列中，测序水平最高的一组。就是黑色部分占据面积最多的哈~(比如下面)，size最大的一个就可以...
您好，电脑是联想Thinkbook，W11系统，未进行任何操作前电脑显示虚拟化已开启，但是我后续勾选hyper-V，开始过程中一直失败，为什么呀？
...if no fossil for root. model = 4 * 0:JC69, 1:K80, 2:F81, 3:F84, 4:HKY85 alpha = 0.5 * alpha for gamma rates at sites ncatG = 5 * No. categories in discrete gamma cleandata = 0 * remove sites with ambiguity data (1:yes, 0:n...
...示的错误，求指点一下，谢谢了。 补充：图中错误问题已解决，文件配置错误导致这种情况的出现，但是我用图中的参数以及视频里老师讲解时候的参数作图，发现图均为以下情况，两个物种的染色体距离非常的近，请老师帮...
已解决
...的实验方法，因此不过于叙述这部分信息。 3.2实验方法筛选 实验方法主要有两种思路：1.通过已知TF寻找未知TFBS；2.通过已知TFBS寻找未知TF。无论哪种手段，前提都是基于蛋白与DNA之间的结合关系寻找，即交叉寻找目标，这有...