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文章 BaiduPCS-Go 报错 | 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed

在使用BaiduPCS-Go上传文件时报错: [1] ↑ 1.03GB/1.03GB 1.81MB/s in 39s ............[1] 上传文件失败, 分片上传—合并分片文件: 遇到错误, 远端服务器返回错误, 代码: 31352, 消息: commit superfile2 failed, 重试 1/3 [1] 准备上传: /share/nas1/bam [1] 上...

文章 一个自动获取最新文献的方法!

...献的方法。 众所周知,NCBI的一个重要功能就是PubMed文献搜索,对该功能加以设置即可定期自动获得最新文献。主要步骤: 打开PubMed网页----登录NCBI账户----文章关键词搜索----点击“Create alert”进行设置----S保存。 PubMed:https://...

问题 分歧时间算不出来结果

...if no fossil for root.          model = 4    * 0:JC69, 1:K80, 2:F81, 3:F84, 4:HKY85          alpha = 0.5    * alpha for gamma rates at sites          ncatG = 5    * No. categories in discrete gamma      cleandata = 0    * remove sites with ambiguity data (1:yes, 0:n...

文章 ceRNA网络构建

...NA和27个差异miRNA。有全部circRNA与miRNA的互作关系。通过筛选,得到64个差异circRNA和23个差异miRNA及其互作关系。 2. ceRNA调控机制:lncRNA与miRNA的互作 通过分析得到17个差异lncRNA和27个差异miRNA。有全部lncRNA与miRNA的互作关系。...

文章 ICGC数据库的数据下载

...于后续的分析使用。 除了上述方法外,我们还可以直接搜索关键词,比如癌症全称等,并指定数据类型,也可以快速地搜索到我们想要的数据。 选择好后点击进入,就可以看到数据相关的信息。 点击右下角的Open in DCC Data Re...

问题 进入docker镜像,命令却粘贴不了了

购买了16S课程。 powershell 在没进入docker镜像前,可以粘贴复制的命令 进入后,却粘贴不了了。请问,啥原因呢,感谢。

问题 motif

鉴定得到的motif和知该基因家族的motif一致性较低,或者说含有更多未知的motif,经多次调试motif的长度和搜索范围,但是还是一致性较低这是为什么呢?是和物种有关吗?

文章 TCGA数据处理流程中各种组织机构介绍

...地分类,处理,质量检验和存储。分析物在BCR被等分并且分配等分条形码,之后送到其它中心。  BCR缩写对照表:https://gdc.cancer.gov/resources-tcga-users/tcga-code-tables/bcr-batch-codesGCC基因组鉴定中心,在这里用高通量技术来分析癌症基...

文章 胃癌免疫侵润预后Signature数据挖掘-4.8分SCI思路解析

...导临床治疗和改善胃癌的预后成为迫切的需要。 signature筛选与模型构建分析流程 数据:TCGA数据库中的胃癌基因表达数据(375个样本),由 UCSC Xena 网站下载得到用于预测模型构建;GEO数据库中 GSE62254 and GSE29274数据集用于模型...

文章 NCBI上下载参考基因组信息

...都可以: 进入下面的这个界面,有不同组装完整的筛选,系统会自动为我们筛选比较好的基因组,一般来说我们选择level这一列中,测序水平最高的一组。就是黑色部分占据面积最多的哈~(比如下面),size最大的一个就可以...

文章 转录组必备说明书!

...就在这里” 组学大讲堂(专业生信教程制作团队,学员超20000人),基于主流测序公司交付的转录组标准分析结果进行了全面的解读,制作了视频教程《转录组分析结果的解读》,累计销量超1000份,一次性解决转录组结果...

文章 基因/蛋白序列结构图绘制-IBS的使用

...FOR DATABASE,目前只支持uniprot一个蛋白数据库,可以直接搜索蛋白质的ID进行绘图,不过小编体验了一下,目前网站存在故障未能运行,不过小编觉得上面2种方式就经够用了。 好了,IBS的绘图技能你get到了吗?动手试试吧! 1...

文章 三代全长转录组鉴定红花黄酮类次代物合成相关相关基因-附原文献下载!

...3. 鉴定与黄酮类次代物合成相关基因 根据KEGG注释结果,筛选到44个与黄酮类合成有关的转录本;由于水稻、拟南芥中黄酮合成相关基因研究更为清楚,所以作者又将该44个转录本与水稻及拟南芥中黄酮合成相关基因进行了blast比...

文章 如何预测蛋白质保守结构域?-InterPro在线工具使用详解

...Add Domain to exclude按钮,添加不包含某结构域条件进行快速筛选。结果展示InterPro结果展示很简洁,如下图,Overview选项下,结构域种类及位置一目了然,将鼠标放置在结构域彩色条上会展示更加详细的信息,除了展示结构域信息...

问题 基因表达量可以查询吗

请问基因在某个物种,某个部位的表达量可以不通过做荧光定量,而是在网站上搜索得到吗?