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问题 计算KAKS报错,本来想通过多序列比对时修改,但是多序列比对软件自己运行,没有办法选择。

老师,我在计算KAKS时报错,本来想通过多序列比对时修改,但是多序列比对时自己运行,没有办法选择。麻烦问一下这样该怎么办?

文章 以OKR驱动企业项目化管理变革

OKR目标管理对公司的意义 OKR大概在2013年传入中国,开始主要是一些有硅谷背景的初创企业在推行,现在OKR逐步受到IT、互联网、高科技企业的追捧,开始变得流行起来,国内知名的互联网公司豌豆荚、知乎都成功的在企业内部...

文章 blastall中的m8结果文件格式介绍,blast+ 中的m6格式

经常使用blast,一般我都是使用m8格式作为blast结果的,但是blast的m8结果竟然没有标题,这是一个坑爹的事情,硬记时间长了肯定忘,那就记录一下吧 首先展示m8结果文件如下: 从图中可以看出共12列,下面来列举一下这12列...

文章 linux下ClustalW2安装

软件下载地址: https://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/help/ 打开网址可以看到有两个下载链接。 FTP和HTTP下载都可以,然后找到最新版本的linux 64位安装包。 右键复制链接地址,在linux中使用wget 命令下载。 wget  http://www.clustal.org/...

文章 教你如何使用u盘安装Linux系统

...选择你要写入镜像的U盘,千万不要搞错,因为这一步会格式化U盘。选择好以后,点击写入,硬盘镜像就会开始制作,我们耐心等待制作完毕。 4,等待镜像制作完毕后,我们就能在系统里看到制作好的U盘,此时U盘的名称都变...

文章 免疫 侵润 分析 ESTIMATE分析

... --- ESTIMATE使用基因表达数据评估肿瘤样本中基质细胞的存在和免疫细胞的浸润。可用于目前公开可用的数据集,以及新的芯片数据或RNA-Seq数据。该方法的预测能力已通过大型独立数据集验证。但ESTIMATE无法准确推断造血...

文章 实验研究中的肿瘤细胞从哪来?肿瘤细胞详解

...每一位科研工作者都试图通过肿瘤研究来攻克癌症,肿瘤细胞是最常接触的研究对象,但是,你真的了解肿瘤细胞吗?关于它的很多基础知识你不一定全都知晓,本期就为大家揭秘这些癌变细胞的基本特征,及我们实验中的肿瘤...

问题 请问Evolview怎么输出16进制颜色?

使用颜色名称(red,yellow)画图一切正常;使用16进制颜色画图预览的时候能正确显示,导出为任何格式都是灰色了,用chrome和Firefox都是这样

问题 请问Evolview怎么输出16进制颜色?

使用颜色名称(red,yellow)时候一切正常;使用16进制颜色的时候画图预览时候能正确显示,但是导出任何格式都是灰色。用的chrome和Firefox都是这样

文章 细胞培养那些坑:细胞长得慢、不贴壁,还有救吗?

各类细胞产品是我们做实验研究的基础,一支小小的细胞,关乎我们各种实验的成功与否,细胞的”小事情“,在实验中都是”大事情“,如果你的细胞出现生长缓慢、不贴壁等情况,那你可要注意了,这就是细胞状态不好的信...

文章 简单实验+蛋白质组=4分文章, So Easy!

...个DEPs被注释到了30个GO terms。生化过程注释了12个GO terms,细胞组份注释到7个GO terms,分子功能注释到11个GO terms。 KEGG注释:通过KEGG富集分析,把562个DEPs注释到了133个不同的生化途径,包括糖酵解、TCA循环以及嘌呤代谢途径。 ...

问题 LINUX系统操作这一节刚打开输入pwd时跟前方框里面不是share,是manger 为啥跟老师打开的不一样

问题 sam 转换成bam 格式并排序时,没转换成功。reads 与基因组进行比对map这里出错。

...进行转录组分析。 在尝试将demo的数据,将sam 转换成bam 格式并排序时并没有转换成功。不太清楚哪里出了问题。 我不知道demo数据是否是链特异性文库,所以也就没去设置(RF or FR)。也不会设置。 所以,是不是文库设置这里...

文章 DIAMOND建库报错

在使用DIAMOND软件的子命令makedb将FASTA格式的蛋白序列创建成后缀为dmnd的数据库文件时,遇到如下报错: 报错原因是蛋白序列中出现了特殊字符,如下图所示: 需要检查蛋白序列文件,去掉不符合要求的序列。再次建库则不...

文章 Rocks集群系统(cluster)的安装与管理维护

Rocks的管理维护 1.添加节点 如果要向cluster添加节点,在主节点上使用 insert-ethers 然后在子节点设定网络启动。实现自动化安装。 2.添加用户 用一般的添加用户的命令进行操作。 adduser username passwd username rocks sync users 特...