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问题 带编制！招聘博后、讲师、副教授。福建农林大学转录系统生物学课题组招聘

...量MNase-seq，ATI，SELEX，ChIP-seq，ATAC-seq，RNA-seq数据，以及分析指导。以下背景优先： 1.基于高通量测序的表观遗传学技术 2. Linux、r或python编程、功能基因组分析 3. 蛋白质/核酸化学、分子机器设计、超分子化学   相关待...

文章 组学大讲堂教程优惠信息

...，涵盖转录调控、群体重测序、癌症数据库挖掘、基因组分析、Linux系统使用、微生物研究、计算机语言（Python、R、Perl）等方向，学员数量已超过35000人！多门课程被推送到网易首页推荐位，并在网易官方的金云奖评选中荣获平...

问题 老师您好，请问一下这种保守结构展示图是怎么画出来的？（图中的C图部分）

老师，您好。我在做motif分析时，MEME展示出来的motif名字就是motif1、motif2、motif3……但我在看文献时发现很多文章展示的是保守结构域（C图），它是从motif命名转化而来的吗？如果是，我怎么知道MEME搜索出来的每个motif是什么名...

问题 请问用cytoscape进行conet网络构建时原始数据文件是怎么得来的

我报名了conet网络构建的课程，用提供的数据文件分析完全可以，但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式，并把数据形式改成和课程提供数据完全一样，再转化成txt制表符文件格式后输入，选择第二个选...

问题 在装作者提供的11g的biolinux系统的时候不能全屏显示，不能挂载，显示no such device

补问：在用官网的biolinux系统做motife分析的时候，输入meme软件的时候，显示没有这个软件，请问怎么安装？ 初涉生物信息，不胜感激

问题 cnvnator -root ${i}.root -tree $workdir/3.map/result/${i}.sorted.dedup.bam -chrom 4

你好，我的参考基因组scaffold有24条，做CNV分析时，命令改怎么调整呢？

问题 Geneflow

...ator_modify.py  -i subsample.reheader.min4.fasta -t test_set1.tsv）进行分析的出现了错误，但是也出现了结果。最后运行的结果如下：这是说明结果是没有检测到基因渗入吗？运行命令出现的错误对结果有影响没有？ test_namep1p2p3p4outdfoil_modes...

文章 R脚本报错|URL 'https://raw.githubusercontent.com/YinLiLin/R-CMplot/master/R/CMplot.r': Timeout of 60 seconds was reached

...Execution halted 多次运行一直没跑过去，可能就是网络信号不太好，过一段时间后就可以跑通了。

问题 GEO数据库下载的表达矩阵转换成genesymbol。

...ext;}for(my $i=0;$i<=$#sampleName;$i++){$expArr[$i]=~s/\"//g;if($samp1e[5]>$pl){next;}push(@{$hash{$sampleName[$i]}},$expArr[$i]);}}}close(EXP);my %probeGeneHash=();open(GPL,"$gplFile") or die $!;while(my $gpl=<GPL>){next if($gpl=~/^(\#|ID|\!|\n)/);chomp($gpl);next if($pl>130);my @gpl...

文章 绘制类似于箱线图的散点图

...因的差异倍数，如下所示： log2FC          Group-0.003569046    SR58-1-0.033401692    SR58-1-0.00595792     SR58-1-0.126160677    SR58-1-0.003569046    SR58-10.062951504     SR58-1-0.085369416    SR58-10.061838866     SR58-1-0.006699121    SR58-1-0.006699121   ...

文章 NCBI基因组数据格式修改

绝大数生信分析都要用到参考基因组数据，但有些基因组的数据会让人十分头疼，例如NCBI上的基因组数据。 其gff文件是这样的： 什么基因ID、染色体编号都是有自己命名规则的，跟我们通常用到的完全不一样。遇到这种情...

文章 使用Python jcvi 时遇到的报错 ，如：FileNotFoundError，如何解决

...为例，如何解决。 这个报错的原因是缺少这个字体。分析：1. 在安装完程序后，重置环境变量 .bashrc 或者.bash_profile ， 可以先重新启动终端。           2.如果是之前安装的程序，可以对其进行升级，升级之后，旧版的没...

问题 http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.0/ 总是打不开

老师，这个网站打不开，是需要翻墙么？ 还是网站歇菜呢？ 在染色体位置和转录本结构分析时有没有其他可以代替的网站或者软件。

问题 cafe做基因家族扩张和收缩，报错Failed to initialize any reasonable values

用cafe5做基因家族扩张和收缩分析，一开始会报错Families with largest size differentials，删除这些差异太大的家族，一直重复删除到如下提示： 不再具体提示差异大的家族ID，但还是报错Failed to initialize any reasonable values，请问各位老...

问题 用组学大讲堂RNAseq Docker镜像时报错 “bash: RUN: command not found”

复盘RNAseq自主分析课程内容，在生成gene length文件时，产生上述报错。 代码：RUN CMD: python /work/rnaseq_demo/my_rnaseq/scripts/get_gene_length_from_gtf.py -g Homo_sapiens.GRCh38.101.chromosome.22.gtf -p gene_length 报错：bash: RUN: command not found