...关：一是种类数目，即丰富度；二是多样性，群落中个体分配上的均匀性。群落丰富度（Community richness）的指数主要包括Chao1指数和ACE指数。群落多样性（Community diversity）的指数，包括Shannon指数和Simpson指数。另外，还有测序深...
...完整序列，可以在NCBI数据库下载，或者在基因组数据中搜索需要ID的序列 这里推荐BED格式数据，数据格式简单，可以在基因组GFF文件筛选基因的这些信息 ， 2、绘图及图片的修改和保存 选中一个数据类型，点击Example，就会...
... 当你还在犹豫基因家族分析能不能发文章时，2000+个同行已经在着手投递文章了，生信技能缺失不是问题，犹豫才是发文路上最大的拦路虎，拿出两天时间，你就能掌握基因家族分析技能！ 抓紧扫描下方二维码，报名组学大讲...
...进行相关性分析，另一个脚本用于对相关性分析结果进行筛选并绘制相关性热图。这两个脚本都只需要准备好相应的输入文件，再进行简单的命令行操作即可。 使用命令示例如下 #相关性分析 Rscript $scriptdir/corr.r -l DDR_deg_gene_TPM...
...i.nlm.nih.gov/ 数据库选择gemome,输入物种拉丁名 Homo sapiens搜索: 搜索结果如下： 包括基因组的信息，gff信息，蛋白质信息等等都可以点击下载，如果基因组组装有多个版本可点击browse list，查看多个版本， 最后的信息为基...
...究打下基础。 基因家族的分析内容都包括哪些呢？ 1、搜索基因家族成员蛋白保守结构域，鉴定基因家族成员； 2、预测基因家族成员的顺势作用元件； 3、构建系统进化发育树； 4、基因家族成员MOTIF分析及绘图； 5、...
...并下载基因序列的方法。 打开NCBI后，选择数据库并输入搜索条件，这里通常搜索的是和分析物种相近的物种，如隶属于同一个科或者属的物种，有时候还需要加上外类群物种。回车，就会检索出我们所需的基因。 有时候需要...
...4.48 10.00 R6SNP-dCAPS-BsrI,63-ccagt-300-0 161 LEFT 281 300 0 YES 20 60.322 55.0 0.0 0.0 4.45 0.0 tcacggcaatcacttcccAg cTgggaagtgattgccgtga 0.433976 13.96 13.96 L3SNP-dCAPS-BsrI,63-ccagt-300-...
...0JADkd: No space left on device 这个错误提示表明在设备上没有剩余的空间用于存储 sort 命令生成的临时文件。通常情况下，sort 命令在执行时会生成一些临时文件来辅助排序操作，但由于磁盘空间不足，无法写入这些临时文件，因此...
...A1 A2 A3 B1 B2 B3TRINITY_DN100001_c0_g1 2.5 2.81 4.75 1.96 2.71 6.11TRINITY_DN100002_c0_g1 0.0 0.00 0.00 0.00 0.00 40.45> dim(data)[1] 2000 6 基本函数为t.test()，并提取出返回值p.value，最终将所有p.value赋值给pvalue向量 ...
我选择了一个基因在NCBI上面搜索，得到了对应的基因，identity conserved domain 得到 点击进去得到的跟您那个NB-ARC的例子不一样 显示这样的，我搜索的domain 是一个超家族的成员，那么再进去是这个超家族的pfam号，这个号可以用...
... ① 目标蛋白序列与目标序列的匹配：应用 FASTA 或 BLAST 搜索软件，在 PIR 、 SWISSPROT 或 GENEBANK 等序列库中按序列同源性挑选出一些同源性比较高的序列，然后把挑选出的序列与目标序列基序多重匹配，得到模板结构等价位点套...
...你更好的使用谷歌浏览器，同时可以正常的使用谷歌学术搜索文献。安装方法可以参考我们之前的文章《谷歌学术搜索可以用了！》（此处可以点击）；3、打开谷歌浏览器，进入“谷歌网上应用店”，搜索“彩云小译”，选择...