...volution.genetics.washington.edu/phylip/software.html 涉及进化树前期分析、构建、编辑美化等多方面的方法、软件等知识,感兴趣可以多了解一点。 2、http://www.treedyn.org/Tree_editors.html 这一网站也提供多种常见和主流的系统进化树编辑处...
.../snapshot/2018-04-07/web/packages/lmem.gwaser/lmem.gwaser.pdf GWAS关联分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq
老师: 安装JDK后,设置环境变量,还是安装不成功。麻烦帮我看下,哪出错了。 JAVA_HOME D:\Program Files\Java\jdk-11 PATH(为啥我的会这么长一串) %SystemRoot%\system32;%SystemRoot%;%SystemRoot%\System32\Wbem;%SYSTEMROOT%\System32\WindowsPowerShell...
...买了《群体遗传进化》课程,后来发现新更新了两节高级分析课程。但是我之前买的课程已经到期了,整个课程现在无法看,想学习新更新的两节课程,请问该怎么学习?有什么渠道可以开放观看这部分内容吗?
老师,做泛基因家族分析,和作者要到的文件是基于每一个参考基因组基因拿到的vcf文件,下面我应该是需要把它们进行合并,但合并所用到的bcftools,使用指令wgethttps://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.10/bcftools-1.10.tar.bz2 ...
这个文件是空的 这个文件正常 这个文件没有变异类型,和教程示例不一样
我用我们实验室的代码跑,好像结果有点不一样。想咨询一下你们的阈值。
怎么计算自己这个物种的突变率呀??画stairway-plot里有这个参数不知道怎么算,手里有vcf文件
看了GEO芯片数据标准化的视频,关于affy包,请问如果后续分析需要未进行log转换数据,那我可不可以对rma处理的数据进行2^x进行反对数转换?还是应该直接用mas5.0标准化?
已经使用MCScanX做了共线性分析得到了collinearity和tandem文件,但我用命令的水平太菜调不出links.txt格式,请问有没有可以用的脚本或者工具之类的?
我用meme分析motif时,部分蛋白在TBtool中显示没有motif,但网页版中motif location中显示motifsites➕scanned sites时可以看到比较矮的motif,那么怎么能在用TBtool做图时显示每个蛋白都有motif呢?
如图,我的bio-linux不是新版的,是之前课程提供的ova包,现在我在做这个共线性分析时提示没有这个模块,现在是必须要重新下载最新的bio-linux包吗,可是那个有10G多,能不能就是可以单独安装这一模块。请老师解答!!
...有列为0的otu,同时也更新了taxonomy_sub,然后进行后续的分析,这一步可以过滤吧?然后我另外筛选出别的组再根据那个组的数据过滤,这一步 过滤 掉该组所有样本都为0的otu是不会影响结果的吧?
...! 因此,实验室的一些危险病原体的研究工作职被推迟,不确定何时才能再次重新开始工作。 这里所说的危险的病原体可能包括:埃博拉、天花、鼠疫、炭疽杆菌等等...... 可以说非常吓人了。 如果你觉得不吓人的话,可以去...
...统,经常要用到git 的一些命令,记录如下: 1. 克隆一个分析流程的代码仓库 # 注意不能再cluster 节点上操作,设置端口为880, 输入自己的用户名和密码 git clone http://192.168.1.100:880/root/rna_seq.git 2. 拉取master 分支 git pull master 3. ...