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问题 您好,我扩增子分类注释报错了,麻烦您帮我看看

... "/work/tmp/UclustConsensusTaxonAssigner_al463L.uc" > "/work/tmp/tmpFpr35JVJzUH7cdtvNUfw.txt" 2> "/work/tmp/tmpW7bSxCiAuQqVCErU3a2S.txt" Traceback (most recent call last):   File "/biosoft/miniconda/envs/qiime1/bin/assign_taxonomy.py", line 417, in <module>     main()   File "/bi...

问题 如何挑选所需的顺式作用元件?

老师好,我的实验是跟饥饿相关,通过分析已经得到了靶标基因的顺式作用元件,但是我如何从这么多元件中,挑选哪些是跟我处理相关的元件。

文章 一分钟让你学会PDCA循环项目管理模式

...开高阶主管会议,研究对策。讨论几小时后,各部门都有少改进的提议,执行长也提出很多要求。最后执行长说:「看广告看疗效,大家要立刻行动起来。散会。」 CEO对大家的态度都很满意。直到有一天,他问负责产品...

问题 PSMC作图为一条直线

老师您好,我使用群体分析中的PSMC流程作图出现这个问题,更换样品也没有用,样品测序深度都在30X以上,但是样品杂合度高,参考基因组质量是很好,请问老师这个问题该如何解决。

问题 PSMC作图为一条直线

老师您好,我使用群体分析中的PSMC流程作图出现这个问题,更换样品也没有用,样品测序深度都在30X以上,但是样品杂合度高,参考基因组质量是很好,请问老师这个问题该如何解决。

文章 qsub任务投递系统的常用命令 SGE任务调度

... (4)-e 错误文件:指定标准错误输出文件的名称。 (5)-p 优先级:指定作业执行的优先级。 (6)-q 主机名:指定要使用的计算节点。 (7)-S 解释器:指定作业使用的解释器。 (8)-V:将环境变量传递给脚本中的程序。 ...

问题 PPI网络蛋白如何转化回mRNA?

请问,以多个mRNA在STRING网站进行PPI分析,并将图导入Cytoscape软件制图后,各个结点是变成了蛋白质的名称了吗?如何转化回mRNA名称呢?谢谢!

问题 PPI网络蛋白如何转化回mRNA?

请问,以多个mRNA在STRING网站进行PPI分析,并将图导入Cytoscape软件制图后,各个结点是变成了蛋白质的名称了吗?如何转化回mRNA名称呢?谢谢!

问题 基因染色体定位

...作图范围,并且这是最重要的,最重要的是我进行前面分析时,也整理出来了我要做的基因在哪些染色体上存在,最后进行mapchart绘图出现了一下情况 整理出来有基因在10号染色体存在,但是绘图时没有基因被绘制在上面 ...

问题 如何判断片段复制?

...似性在50%左右。 2.它们存在于同的染色体上 3.共线性分析查看两个基因上下游的基因也没有重合。 4.在发育树上的拓扑结构是与其他近缘物种分别处在两个分支。(近缘物种也有这两个基因) 因此目前排除串联复制和全...

问题 误删文件导致docker启动了了

老师好,我在练习泛基因家族分析课程,误删了如图所示local/share/containers/storage/overlay 下面的文件,可能是这个原因导致docker启动了了,我应该怎么解决

问题 我在用snpeff进行snp注释的时候,发现出现如下错误java.lang.RuntimeException: Error reading file '/home

...最后一行添加自己基因组的信息:ath.chr1.genome=。。出现能读取或者能genes文件的错误,能够建库生成snpEffectPredictor.bin文件,请问是除了什么问题

问题 什么是参考基因组

物种的参考基因组指的是什么,比如果蝇是昆虫纲双翅目的昆虫,是模式生物,有全基因组;我如果分析瘿蚊呢?瘿蚊是昆虫纲双翅目瘿蚊科的昆虫,对于这种同目同科的物种,是否可以将果蝇作为瘿蚊的参考基因组去用

问题 求助mRNA ID 批量+1问题

你好,我在分析转录组数据是出现如下问题: 查资料发现你也遇到类似问题,看老师给出的解决办法:mRNA ID和基因ID相同了,你把所有的mRNAID后面批量加一个.1,请问你这个问题解决了吗?

文章 GATK MarkDuplicates报错:Caused by:Too many open files

...m --METRICS_FILE sort.dedup.metrics --MAX_SEQUENCES_FOR_DISK_READ_ENDS_MAP 50000 --MAX_FILE_HANDLES_FOR_READ_ENDS_MAP 8000 --SORTING_COLLECTION_SIZE_RATIO 0.25 --TAG_DUPLICATE_SET_MEMBERS false --REMOVE_SEQUENCING_DUPLICATES false --TAGGING_POLICY DontTag --CLEAR_DT true --DUPLEX_UMI false --FLOW_MO...