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问题 Admixture算STRUCTURE，出来的CV erro值随着K增大而递增是怎么回事，算了好几组数据都这样

...果的CV值都随着K增大而递增，用的是群体遗传进化课程中docker的代码，如下： workdir=/work #设置工作路径 refdir=$workdir/ref datadir=$workdir/data scriptdir=$workdir/scripts export PATH=$scriptdir:$PATH GROUP=$datadir/yuan.txt #LD过滤 plink --vcf  $wo...

文章 生成OTU方法如何选择，OTU/ASV?

...易云课堂上有各种教学视频，有兴趣可以了解一下： 1.docker 生物信息工具安装 2.OTU网络图 3.R 语言入门与基础绘图 4. 转录组标准分析后的数据挖掘 5. 微生物16S/ITS/18S分析原理及结果解读 6. 更多学习内容：linux、perl语言画...

文章 qRT-PCR相对定量计算详解 qPCR

...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...

文章 canda 安装的jcvi 遇到字体错误： UserWarning: findfont: Font family [u'sans-serif'] not found. Falling back to DejaVu Sans (prop.get_family(), self.defaultFamily[fontext]))

...课程6. 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到...

文章 机器学习文章套路-预测土壤枯萎病-ISME IF=9

...研究微生物多样性，您选对区了吗？11.微生物多样性分析docker镜像使用12.生成OTU方法如何选择，去噪还是聚类？13.微生物多样性组间差异分析—STAMP使用！14.16S rDNA你知道多少？

文章 TCGA数据库重大更新-数据如何下载？

...ormaticsFMRP/TCGAbiolinks") 或者用我们组学大讲堂提供的最新 docker镜像，里面已经更新了最新的TCGAbiolinks包：  omicsclass/r-server:lastest 用命令行代码《tcga_gene_exp_download.r》自动下载表达数据，运行命令如下： Rscript tcga_gene_exp_download....

文章 cactus-bin-v2.9.9 安装笔记

...i}; done````vcfwave` isn't included in the release binaries (but is in the docker image).  You can can try building it and adding it to `bin/` with the following command```build-tools/downloadVCFWave```## TestingTo test Cactus, the following will run a tiny sumulated alignment.```cactus ./jobstore ...

文章 2区纯转录组文章如何写作？

...，不可错过，内容涵盖：   （1）生信语言与工具基础：Docker安装与使用、linux系统入门、Perl语言入门到精通、Python生信入门到精通、perl语言高级编程   （2）生信绘图技能：R语言基础与绘图、R语言绘图基础（ggplot2）   （3...

文章 人工智能（AI）在微生物组中的应用-随机森林分类与回归预测

...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...

文章 qiime2 分类器建立 SILVA数据库

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文章 一秒让你读懂 DevOps 的本质及行业现状与趋势

...企业重视。DevOps 概念的深入人心，离不开云计算、容器 /Docker、微服务、敏捷等相关概念和实施的成熟发展。其背后本质是企业 IT 的精益运营，以面对更快的业务试错与业务创新。 概念虽好，落地却难？ DevOps 的一个巨大好...

问题 ANNOVAR变异注释报错：Erro: invalid record found in exonic_variant_function file (exonic format error)

...组学大讲堂的云服务器，没有权限，不知道我们所使用的docker镜像和云服务器中的脚本是否是最新的？ 看到也有别的人提了相似的问题，可能在refGene,cytoBand,1000g2014oct_eur,1000g2014oct_afr,exac03,ljb26_all,clinvar_20140929,snp138中找不到的...

文章 DevOps 从理论到实践指南

...合 DevOps 端到端交付团队的设计，近年随着容器化技术（Docker）的发展，容器管理（Kubernetes）的日渐成熟（据悉，github 已经将它们的一部分产品环境灰度发布到了 kubernetes 上，京东也将他们的服务百分之六十采用了 kubernetes 管...

文章 群体遗传进化名词解释

...程 6. 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...

文章 实验室linux生物信息服务器搭建CentOS7

...视频课程：实验室linux生信分析平台搭建 linux中安装使用docker： https://www.omicsclass.com/article/1181 1.计算机硬件选择 1.1 根据工作环境与预算选择： 土豪实验室：预算充足且有专门的机房，建议选择刀片式服务器，可扩展性强...