... os上进行文件共享服务，由于它的脆弱的验证机制，所以不适宜在internet上工作，在内网使用是非常可行的。 nfs服务端需要确定这两个包正确安装 nfs-utils rpcbind 若是ubuntu服务器，则是nfs-common，nfs-kernel-server两个包，rpcbind是默...
基因家族分析视频中的Circos绘图课程中有个叫genome.txt的配置文件，请问具体应该怎样生成，打开如图所示，里边的数字视频中说的存在线性关系的染色体区块，请问来源是哪里呢，是MCscan课程中生成的AT.tandem文件吗？但是里边...
...组装基因组之后，进行assembly_stat的环节。在进行gc-depth 分析的时候，需要将CCS测序的reads比对到组装的基因组上，用的命令是：minimap2 -t 10 -ax map-hifi contig.fa $hifi > aln.sam。然后将sam转换成bam文件，命令是：samtools sort aln.sam -o...
...=false) 解决方案： 意思是说：此linux的内核中的SELinux不支持 overlay2 graph driver ，解决方法有两个，要么启动一个新内核，要么就在docker里禁用selinux，--selinux-enabled=false 重新编辑docker配置文件： vi /etc/sysconfig/docker 改为...
上图是我用mcscanX跑出的物种内共线性分析的文件，这个文件里的基因对就是Segmental吗？
...teMachines\StartTransition.cs:行号 92 docker安装中遇到的问题，不知道如何解决
输入文件 运行代码 #go 富集分析 Rscript $scriptdir/go_enrich.r -l gene.list -n $scriptdir/go2name.tsv \ -g go2gene.tsv -o go 输出文件 咱们的课程是输出很多文件，但是我只能输出一个
根据基因家族分析课程中的视频，运行perl脚本后，提取失败，第一行是输入的代码，第二行是运行后的提示。请老师解答，谢谢。 manager@bl8vbox[share1] perl script/get_gene_weizhi.pl -in1 gene_id.txt -in1 MedtrA17_4.0.41.gff3 -out gene_weizhi.txt usage:...
...够随机那么就能均匀的覆盖基因组所有区域，满足我们的分析要求。
不太理解就是当所有的下机数据合并成vcf文件，后续需要建树和扫描清除分析时应该怎么填写分组txt？
使用ggraph绘图，在结果导出pdf的时候报错，不可用的字体类型“invalid font type” 如果继续使用ggsave导出，可以直接载入字体： library(showtext) font_add('Times','/Library/Fonts/Times.ttf') showtext_auto() #调用showtext使其能够在ggsave()中使...
...sites.2015_08 给出千人基因组计划数据（2015 年 8 月公布的版本）的所有人群中，该变异位点上突变碱基的等位基因频率 EAS.sites.2015_08 给出千人基因组计划数据（2015 年 8 月公布的版本）的亚洲人群中，该变异位点上突变碱基的...
老师，您好，我想问一下您这里https://www.omicsclass.com/article/446介绍的qPCR验证测序结果，其中相关性分析里Log2(FC)qPCR的值是三个样本的log2FC取均值吗？因为测序结果就一个FC，但是qPCR每个样本都有一个2^-△△Ct值呀？
我分析的群体是果树的F1，具有25条染色体，因此我想要分成25个连锁群。利用zcat p.call.gz | java -cp /mnt/e/QTL/20240813HLVCF/my_genetic_map/01.PrepareData/Lep-MAP/bin SeparateChromosomes2 sizeLimit=30 numThreads=10 data=- lodLimit=$lod usePhysical=1 0.000000000001 >...
...差异表达基因数量达到峰值，因此选定该时间点进行后续分析。在单细胞层面，研究采用10x Genomics平台对对照组（CK）和病菌处理组（Foc TR4）的香蕉根尖进行单细胞核转录组测序（snRNA-seq） 两个重复，通过提取细胞核而非原生...