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文章 百万样品GWAS解释精神疾病间的遗传关系

...neri Anttila et al. Analysis of shared heritability in common disorders of the brain. Science, 2018; 360 (6395): eaap8757 DOI: 10.1126/science.aap8757

问题 下载甲基化数据时找不到样本类型，

...) :   Primary solid Tumor was not found. Please select a difinition from the table above 

文章 群落分析的冗余分析（RDA）概述

...C R. The use and interpretation of principal component analysis in applied research. Sankhya, A, 1964, 26(4):329-358. 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接：基因家族分析实操课程、...

文章 某网络小说作者：我要去发篇Nature了，小说停更。。。。

...选了3个，希望对大家有帮助。 1，Biochemical and Biophysical Research Communications，简称 BBRC IF: 2.559 (连续5年基本都在2.5左右) 中国来源稿件：42.56%(友好但没泛滥) 生物化学与分子生物学(4区) 版面费：可以选择不OA就不用付费，OA的话1...

问题 老师您好，docker镜像加速后，下载你们的gwas镜像时，总是pull了一半，剩下的立刻就没反应了，尝试了几十次，这个怎么回事?

...dial tcp 104.18.122.25:443: connectex: A connection attempt failed because the connected party did not properly respond after a period of time, or established connection failed because connected host has failed to respond.

文章 基因家族共线性分析，利用python 版本的MCScanX分析物种之间分共线性

...mily in Brassica napus, 04 January 2023, PREPRINT (Version 1) available at Research Square [https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-2344198/v1]MCscan就讲到这了，有兴趣的同学赶快试一下吧

文章 OthroFinder-物种同源基因分析工作原理

Orthofinder是做直系同源基因分析时常用软件，除此之外，还可以使用OrthoMCL，今天主要介绍Orthofinder软件的工作流程。 1. Orthofinder发表的工作流程如上图：     1.1 （a）将所有物种的全部蛋白序列通过序列比对和调用MCL聚类实...

文章 遗传图谱构建基础知识

...完全连锁重组率r=0.5时，不连锁 LOD值 概念：LOD = Log of the likelihood odds ratio ，估计值在观察结果中出现的这种概率的可能性。用来反映重组率估计值的可靠性程度或作为连锁是否真实存在的一种判断尺度。计算公式：LOD=Log10(L(r)/...

问题 tassel计算PCA

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问题 tassel 计算PCA

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文章 TCGA数据下载—TCGAbiolinks包参数详解

... Institute ( NCI, 美国国家癌症研究所) 和  National Human Genome Research Institute (NHGRI, 国家人类基因组研究所) 合作建立的癌症研究项目，通过收集整理癌症相关的各种组学数据，提供了一个大型的，免费的癌症研究参考数据库。 官方提...

文章 Metadata CRC error detected at xfs _ bmbt _ read _ verify+0x12/0xb0 [xfs], xfs _ bmbt block 0xc9132f8 [ 4.863216] XFS(dm-0): Unmount and run xfs _ repair

...ating"/ run/ initramfs/ rdsosreport. txt"  Entering emergency mode. Exit the shell to continue.  Type"journalctl"to view system logs.  You might want to save"/ run/ initramfs/ rdsosreport. txt"to a USB stick or / boot  after mounting them and attach it to a bug report. :/# 11  sh: 11: com...

文章 单细胞转录组数据挖掘流程记录-BCC 基底细胞癌（GSE123813）

...ter UMAP1 UMAP2bcc.su001.post.tcell_AAACCTGAGCTTCGCG su001 post CD45+ CD3+ CD8_mem_T_cells -8.49122047424316 5.53352499008179bcc.su001.post.tcell_AAACCTGAGGACATTA su001 post CD45+ CD3+ CD8_ex_T_cells 4.62372446060181 6.66859436035156bcc.su001.post.tcell_AAACCT...

文章 微生物多样性16S计算物种累计曲线

...ci.col = "lightblue", main = "Species Accumulation Curves", xlab = "Number of samples", ylab = "Number of species") boxplot(all, col = "yellow", add = TRUE, pch = "+") dev.off()绘图结果：最终的物种累计曲线中，横坐标是样本个数，纵坐标是发现的物种个数，随着...

文章 遗传图谱构建基础知识

...完全连锁重组率r=0.5时，不连锁 LOD值 概念：LOD = Log of the likelihood odds ratio ，估计值在观察结果中出现的这种概率的可能性。用来反映重组率估计值的可靠性程度或作为连锁是否真实存在的一种判断尺度。计算公式：LOD=Log10(L(r)/...