R包可以存放在不同的仓库(repository)里，最常见的repo包括CRAN, github，以及生物er必需的Bioconductor。 CRAN，官方包CRAN，通常国内选择镜像，方法自行百度。 Bioconductor，这个通常只有生物信息学的人才用得到。 Github，...
....ADC和生物偶联，生物偶联涉及将“分子连接”在一起。 不清楚是否有其他相关的解释场景？
请问老师，手里有很多样本的重测序数据，想把某个基因的序列全部提取出来，是可以直接从比对文件中，按照染色体的位置提取？还是说可以根据基因ID进行提取呢？我知道vcf文件是不可以的，vcf文件里是SNP的信息。
...c(coordinates) head(coordinates) tissue_positions_list.csv 这个文件不应该有表头的； 如果有应该去掉
...全基因组外显子区域DNA富集后再进行高通量测序的基因组分析。外显子组包含约1%的基因组（约30MB），却包含约85%致病突变，与个体表型相关的大部分功能性变异也都集中在染色体的外显子区。能够识别单核苷酸变异体(SNVs)、小...
... 204 0.206478chr01 384719 988 0 202 0.204453chr01 518438 988 0 488 0.493927chr01 518473 988 0 452 0.45749chr01 518579 988 0 418 0.423077chr01 518635 988 0 428 0.433...
...load filename -v #上传指定目录数据到百度网盘bypy文件夹下 5. 取消授权，输入bypy -c bypy -c
...基因组重测序，大多做群体遗传进化，或者全基因组关联分析（GWAS）的确能发高分文章，很多发表在Nature，Nature genetic等国际著名期刊上。但是，对于哪些大牛的文章，动辄测几十上百甚至上千的样本量，对于经费紧张的老师也...
...A数据挖掘感兴趣，请学习我的TCGA系列课程： 《TCGA-生存分析》 《TCGA-基因差异表达分析》 《TCGA-转录因子调控》 《TCGA-ceRNA调控网络分析》
我看近几年发的基因家族文章挺多的，但是自己研究的是模式植物，不知道能不能发啊？
...蛋白质组的项目越来越多，经常有蛋白质和转录组相关的分析。 deg_file <- 'S-1_S-2_S-3_vs_R-1_R-2_R-3.all' dep_file <- 'S-1_S-2_S-3_vs_R-1_R-2_R-3.DEP.all.xls' # 设置筛选参数 dep_fc <- 1.5 dep_fdr <- 0.05 deg_fc <-1.5 deg_fdr <- 0.05 # 读取文件 ...
...者，是指没有接受过radiation/drug ,还是说没有相关数据，不知道他们是否有接受radiation/drug呢？请问是否官网有相关介绍？谢谢您！
想问一下，有没有喷过遇到过类似的问题，在油菜的基因组中有很多scaffold，超出了400，显示做不出来，这应该怎么解决？
...nd variance of c参考文献 https://bytebucket.org/tasseladmin/tassel-5-source/wiki/docs/Tassel5UserGuide.pdf?rev=de63405b4da1dbbf2471db580c805978f1c8195d https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4744023/