找到约 15 条结果

问题 只提取出来一个是为什么呀?是对呀?

是因为只用了domain1,domain1的基因太少了吗?如果这种情况的话,分析还有意义吗?

文章 ncbi sra数据批量下

...组建重复,因此如果没有批量下的手段还是挺麻烦,总能一个个点吧 一般而言有两种常见方法 1 SRA Run Selector直接获取,这个页面链接如下,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/操作也简单,直接搜索project ID号,就可以了 然...

问题 蛋白结构域完整性的验证

您好!老师。最近学习了组学大讲堂的基因家族分析课程,有个问题想请教您。 比如说我鉴定到一条NBS-LRR基因,用NCBI中的CDD工具发现它的NBS结构域是完整的,但是用Pfam数据库验证又是完整的,让人很迷惑。 到底该怎样去...

文章 多种进化树编辑处理软件

...volution.genetics.washington.edu/phylip/software.html 涉及进化树前期分析、构建、编辑美化等多方面的方法、软件等知识,感兴趣可以多了解一点。 2、http://www.treedyn.org/Tree_editors.html 这一网站也提供多种常见和主流的系统进化树编辑处...

文章 GWAS模型描述方法

.../snapshot/2018-04-07/web/packages/lmem.gwaser/lmem.gwaser.pdf GWAS关联分析课程推荐:https://bdtcd.xetslk.com/s/2KgXQq

问题 java -version是内部命令或外部命令或批处理文件

老师:        安装JDK后,设置环境变量,还是安装成功。麻烦帮我看下,哪出错了。 JAVA_HOME D:\Program Files\Java\jdk-11 PATH(为啥我的会这么长一串) %SystemRoot%\system32;%SystemRoot%;%SystemRoot%\System32\Wbem;%SYSTEMROOT%\System32\WindowsPowerShell...

问题 购买的《群体遗传进化》新更新的课程怎么观看

...买了《群体遗传进化》课程,后来发现新更新了两节高级分析课程。但是我之前买的课程已经到期了,整个课程现在无法看,想学习新更新的两节课程,请问该怎么学习?有什么渠道可以开放观看这部分内容吗?

问题 vcf文件如何合并

老师,做泛基因家族分析,和作者要到的文件是基于每一个参考基因组基因拿到的vcf文件,下面我应该是需要把它们进行合并,但合并所用到的bcftools,使用指令wgethttps://github.com/samtools/bcftools/releases/download/1.10/bcftools-1.10.tar.bz2 ...

问题 老师,我做泛基因家族鉴定时,06.SV_analysis最后得到的All.final.sv.out基因结构变异信息只有一条,请问哪里可能有问题

这个文件是空的 这个文件正常 这个文件没有变异类型,和教程示例一样

文章 ls常用参数及ls只列出部分目录或文件

...录 (ls内定将文件名或目录名称开头为"."的视为隐藏档,会列出)。 -A 同 -a ,但列出 “.” (目前目录) 及 “…” (父目录)。 -l (默认字母序)除文件名称外,亦将文件型态、权限、拥有者、文件大小等资讯详细列出。常用l...

问题 老师好,有关blastall参数的问题!

老师您好,目前本人再做MCscan共线性分析,目前根据视吧图做了出来,但是线条数量比较少,在之前除了建立索引就剩下这条命令了。因此想了解一下会会这条语句blastall -i fuck.fa -d fuck.fa -e 1e-10 -p blastp -b 5 -v 5 -m 8 -o fuck.blast...

问题 您好,我是买了群体研究合辑的学员,然后我用您的代码跑BSA。我想问你们的默认两条阈值线设定的是多少?

我用我们实验室的代码跑,好像结果有点一样。想咨询一下你们的阈值。

问题 stairway-plot里的mu(每代每位点的突变率)参数怎么确定?mu: assumed mutation rate per site per generation.

怎么计算自己这个物种的突变率呀??画stairway-plot里有这个参数知道怎么算,手里有vcf文件

文章 多图对比在腾讯、阿里、字节跳动的工作区别?

...要花光一辈子的运气; 字节跳动:每年两次,晋升面试用 ppt。 内部称呼 腾讯:员工起英文名,例如 Gangdan Wang= 王钢蛋; 阿里:花名,例如矮大紧 = 高晓松,还有尼玛、土豪、呵呵、蛋疼等奇葩花名; 字节跳动:直接...

问题 关于基因芯片affy包rma标准化

看了GEO芯片数据标准化的视,关于affy包,请问如果后续分析需要未进行log转换数据,那我可可以对rma处理的数据进行2^x进行反对数转换?还是应该直接用mas5.0标准化?