文章 GWAS模型介绍

...线性模型(compressed MLM, CMLM)，并将这两种方法整合到TASSEL软件中，大大提高了计算效率，检测功效也得到提高。P3D减少了重复计算方差组分的次数；CMLM通过聚类减少了实际参与计算的样本数。考虑到8种聚类方法和3种组间亲缘关...

问题 老师您好，我在搭建t2t基因组时候，hic挂载时，使用bwa aln和sampe比对时说版本不一致无法使用，查找原因说是因为大于100bp，现在使用bwa mem比对后就格式不一样，使用课程里的allhic的PreprocessSAM.pl和filterBAM_forHic.pl就无法使用了，格式不对，修改脚本后过滤出9.8g的bam文件，使用ALLHic_partition进行分组设置k=15，但是分组运行后只能分出1组，该怎么办呢？这是什么原因？

文章 circos-基因组圈图绘制软件基础绘图

...上具体的位置将基因作为label显示。 核型文件（chr.info）格式如下所示： chr     -       1       Chr1    0       30427671        chr1chr     -       2       Chr2    0       19698289        chr2chr ...

问题 如何解决meme-v4.12.0软件下载

您好，请问这个问题您是怎么解决的。

文章 火山云 | tos:// 数据下载 | windows/linux下载方式

....com/docs/6349/148777 01-2：双击下载的安装包.exe，即可安装打开。 01-3：在登录页面选择“共享连接登录”，输入 共享连接 ，即可登录下载。 01-4：使用共享链接登录 TOS Browser 后，只拥有对应文件或文件夹的读权限。链接失效...

问题 数据表达量一方为零，怎么计算FC

...对照中，正常组高表达，而肿瘤组中无表达，这样的数据怎么进行FC的计算。能否采取给这些零值赋予极低的表达量，还是单纯的删除这些无法得出FC值，因为注意到有p值出现

话题 集群管理

话题 管理员

话题 生物工程

话题 #进程管理

话题 进程管理

文章 rocks集群管理命令

快速关闭所有计数节点： rocks run host compute "shutdown -P now"

问题 测序公司返回的DNA序列，在序列比对时是不是要删除首尾的一些序列？计算保守位点变异位点是不是根据比对后的序列算？多条DNA序列，比如ITS，MatK两条序列怎么拼接起来作为一个组合DNA序列片段来分析？有没有软件和教程，谢谢

文章 bam文件出现负坐标

... read_cut_positions(cut_file):    """    读取切割位置文件    格式：染色体<TAB>切割位置    例如：chr1<TAB>120000000    """    cut_dict = {}    try:        with open(cut_file, 'r') as f:            for line_num, line in enumerate(f, 1):      ...

文章 鲈鱼MAPK基因家族分析文献下载及解读

...个性化分析，求人不如求己，一切痛点都能解决： 1. 单细胞/空间转录组正在大火，高分文章必备，0基础学单细胞/空间转录组分析，做更牛的个性化分析，绘更漂亮的图，点这个链接：单细胞/空间转录组分析实操  2. 2区文章...