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老师您好,我在搭建t2t基因组时候,hic挂载时,使用bwa aln和sampe比对时说版本不一致无法使用,查找原因说是因为大于100bp,现在使用bwa mem比对后就格式不一样,使用课程里的allhic的PreprocessSAM.pl和filterBAM_forHic.pl就无法使用了,格式不对,修改脚本后过滤出9.8g的bam文件,使用ALLHic_partition进行分组设置k=15,但是分组运行后只能分出1组,该怎么办呢?这是什么原因?
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提出于 2025-08-12 18:03
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