... /public/software/singularity/bin/singularity exec /public/home/huangyou/docker-images/reseq-v2.0.sif gatk --java-options HaplotypeCaller -R /public/home/wangyongsheng/PepsiCo_OT3098_V2_panoat_nomenclature.fasta \ -I /public/home/wangyongsheng/oats/text/picard-bam/${i}.sorted.dedup.bam \ -O /pub...
...大讲堂不再支持vbox中的biolinux，转向用更好的虚拟机工具Docker，学习安装使用课程见： https://zzw.xet.tech/s/3Rcvt0 更多生物信息课程： 1. 文章越来越难发？是你没发现新思路，基因家族分析发2-4分文章简单快速，学习链接...
...来，就是到了arrow和着色就不行了，想问一下，在咱们的docker里面是不是路径有问题，或者python的版本低了呢？请帮忙解答一下，谢谢了。 第一次出现问题：频率最高 第二次出现问题：
你好，我想问一下，基因家族分析的第6课时，老师演示在dockerdesktop里面进行复制和解压，在这之前打开powershell，在里面输入的运行docker的命令是什么，
... ①课程针对0基础学员设计，半自动化分析； ②采用docker虚拟机技术，不同操作系统保持一致分析步骤； ③云服务器上教学，避免电脑性能不足； ④提供回放视频，两年内可反复学习； ⑤问答社区解决售后技术问题。 报...
老师您好： 我是根据docker课程学习基因家族，做自己的物种，共鉴定到22个HSP70基因，，到MCScanX的时候，使用excel的vlookup函数，找到一对串联重复的基因，但是没有大片段复制的基因，作图时也没有红色的线条，，，...
#添加分类信息时报错 这是用qiime2分析完数据后，再利用qiime分析时候报错 #自己用服务器进入的ampliseq-q1:v1.2使用的命令：docker run --rm -v /disk1/liuh/qiime2:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 请老师帮忙解答一下，谢谢。
查了路径，设置好了，也重新进入docker重设路径了，还是不想，一直提示不存在
... ① 课程针对0基础学员设计，半自动化分析； ② 采用docker虚拟机技术，不同操作系统保持一致分析步骤； ③ 云服务器上教学，避免电脑性能不足；④ 问答社区解决售后技术问题。 秋季线下培训班详情： 一、“群体重测...
...步。 生物信息入门到精通必修基础课：linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...
...服务器分析，自己电脑仍可正常办公； ③ 采用先进的docker虚拟机去教学（国内首创），无需担心安装生信软件、配置分析环境等难题，不同操作系统下分析步骤基本一致，真正的能学会，能用起来； ④ 内容丰富，课程内容...
Linux服务器上，运行提取结构域的脚本的时候，出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误，请问如何解决，这个问题之前有提过，但是没有人回答，有人只是指出可以安装docker，但是需要root用户安装，没有root权限的用户怎么办
...式同otu_table后跟物种注释） 2.转换成biom格式文件：（docker上下载QIIME1镜像） biom convert -i mat.txt -o otu_table.from_txt.biom --table-type="OTU table" --process-obs-metadata taxonomy --to-hdf5 3.在运用QIIME1脚本进行分类： 不同水平下相对丰度文件：...
...是这样 基因数据在这个位置，这是我新修改的软链接，docker run -it --name pangenefamily --group-add keep-groups -v ~/pan-gene-family/:/work -v /home/us367/pan-gene-family/pan-gene-family_maize/data:/work/pan-gene-family_maize/data -v /home/us367/pan-gene-family/pan_gene_list/da...
...在做基因组注释时，PASA_assembly中，seqclean报错，使用的是docker的镜像，已添加export USER='me' 报错信息如下： /work/zhushi/04.PASA_assembly/UniVec seqclean running options: seqclean all_transcripts.fasta -c 10 -n 10000 -v ./UniVec Standard log file: seqcl_...