例如：只有***.genomic.fna文件和***.gff文件，能通过blast搜索家族基因吗？如何搜索呢个？
...有尝试过quickmerge合并基因组，但这三个版本LAI最高也就8.81，合并后会比最高的高吗？ 2.这是一个植物基因组，重复序列中unknow比例有30%，使用deepte后能降到20%，但80%重复序列加20%unknow是不是高的不太正常？ 3.完成基因注释后...
#!python# coding:utf-8'''##############################################################################################北京组学生物科技有限公司#author huangls#date 2021.01.26#version 1.2#学习python课程推荐：#python 入门到精通(生物信息):#https://bdtcd.xetslk.com/s/2bdd89##...
...部门或团队负责人需要重点考虑的问题。对项目进行拆解分配的时候会用到项目管理常用的任务分解方法-工作分解结构（WBS）。工作分解结构就是指以可交付成果为导向对项目要素进行的分组，它归纳和定义了项目的整个工作...
老师您好，我按照课程中给的代码读取WGCNA基因表达数据，数据格式与示例数据相同，为什么每次dim之后就只有0行和1列呢，后面的筛选也筛选不到基因，聚类树也画不出来，求解答
您好，我在用iqtree跑进化树的时候，分配了55G内存，软件报错说内存不够，但是说需要54G，并且软件还在继续运行，占用内存最后飙到了120G，请问这个应该怎么解决？ ps：实验室服务器内存180G，我能调用的内存就120G
...联分析中，如果对每个位点进行测试，以0.05的水平进行筛选，由上文可知，在1000000个位点中其假阳性的位点可能达到5%，即50000个，所以，为了控制假阳性的概率，以Bonferroni校正对阈值进行调整。Bonferroni校正会将设定的显著性...
老师您好，按照课程筛选串联重复基因，我找到了6对，然后绘制了circos图如下，但是发现我的这些结果应该都不是串联重复的呀，是我筛选错了么？这6对基因中的每一对相似性都在95%以上并且都是相同基因，这应该是同源基因...
...并从Pfam数据库下载ARF的隐马尔科夫模型PF06507。通过HMMER搜索(e<10-5)及Pfam、SMART数据库二次确认，最终共鉴定出35个ARF家族成员，分布在26个玉米基因组中。针对26个品种中分别存在的ARF基因数量绘制柱状图(图A)35个家族成员中包...
...grep（Global Regular Expression Print）是一个用于在文本文件中搜索字符串或正则表达式的命令行工具。它可以有效地查找包含特定模式的行，并将其打印出来。今天，我们结合以下示例，深入了解一下grep命令的详细使用方法。 grep是...
...止于终止子，都可以叫做ORF。ORF是一种预测，而不是一种已知的翻译区 CDS: Coding DNA Sequence，是指mRNA序列中编码蛋白质的那部分序列。属于ORF（open reading frame），既然编码蛋白，那肯定以ATG开始--终止密码子结束。 CDS,start_codon...
老师您好，请问我在进行GEO差异基因筛选时，芯片的对照组只有2组，而实验组有50组，这样分组筛选出来的差异基因合理吗？