... 和genomescope.R -m教程中设置的1000000，不同物种有差异吗，怎么选择呢？ jellyfish histo -v -t 4 -h 10000000 -o illu.histo illu# histo输出k-mer频率直方图数据，统计出现了x(x=1,2,3…)次的kmer的数目y# -v 输出详细信息# -h 最高计数值genomescope.R -i i...
...同样，我们可以通过awk将两个文件中首尾相接的行合并在一起： $cat file1 chr 1 chr 2 chr 3 chr 4 chr 5 chr 6 $cat file2 1 69 2 890 3 568 3 688 4 39 5 80 6 90 $awk 'FNR==NR{t[$2]=$0; next}{print t[$1]"\t"$2}' file1 file2 chr 1 69 chr 2 890 chr 3 568 chr 3 688 chr 4 39 chr 5 ...
...为所有的对象距其所属的 cluster 的中心点的距离的平方和，优化变量为每个 cluster 的中心点以及每个对象属于哪个 cluster；此优化问题被证明是 NP-hard 的，但有一些迭代算法可以找到近似解，k-means 算法 即是其中的一种。基...
...入文件准备 第一个脚本corr.r需要两个输入文件，通过-l和-g参数指定，需要注意的是当要在两两变量之间进行相关性分析并绘制热图时，这两个参数指定同一个文件即可（DDR_deg_gene_TPM.tsv）。也可以指定不同的两个文件寻找不同...
...间的spearson 系数，如下图。我想问一下，在制图过程中，怎么设置这个ρ和p的范围呢，是在conet 的method mean这个菜单中填入相应的值吗，还有permutations和bootstrap这个值是怎么设置的呢？那个spearson correlation 在计算之后又是如何查...
...成计算过程。 譬如有如下数据，共2000行6列，对A组数据和B组数据进行t.test计算： > head(data,2) A1 A2 A3 B1 B2 B3TRINITY_DN100001_c0_g1 2.5 2.81 4.75 1.96 2.71 6.11TRINITY_DN100002_c0_g...
...为跳槽热门去向，那么在这三家公司工作有什么区别呢？一起来看—— 旗舰产品 擅长领域 腾讯：是社交领域的霸主； 阿里：是电商界的巨头； 字节跳动：是内容领域的王者。 公司特色 腾讯：产品文化，小马哥是...
登录节点的环境都配置的比较好，但是有时候任务投递到计算节点后，计算节点在运行的时候，系统环境用的是自己的，没有用登录节点的环境，导致报错，这里能不能ssh切换的时候，登录节点的的环境也跟着同步
在软件项目开发中有一些不同的角色，但很容易让人陷入在概念和责任交叉的误区里。 在本文中，我们着重来过考量 IT互联网行业的三个主要职位：产品经理，项目经理和产品经理。这些专家都是项目开发的关键角色，似乎...
...因组分析，对分析结果缺乏系统的了解，无法高效的挖掘和研究目的相关的结果，进而影响了文章的发表以及成果的转化。 课程内容 第一节：宏基因组基础知识 课程目标：快速掌握微生物群落结构、功能及生态学意义，理解...
...时候，会自动过滤掉indel。我想同时计算indel的p值，需要怎么做？代码如下： run_pipeline.pl -Xmx30G -fork1 -h hapmap.ordered.hmp.txt \ -fork2 -t $tassel_trait -fork3 -q $structure -excludeLastTrait \ -combine5 -input1 -input2 -input3 -intersect -FixedEffectLMP...
...对 SNP 进行注释，其中包括 dbSNP 数据库、千人基因组计划和其他已有的数据库的注释信息，注释内容涵盖变异的位置信息，类型，保守型预测等。 注释之后会得到一个表格文件解释如下，更多数据库解释说明https://www.omicsclass.co...
...个体相对，是个体的共同体，不同个体按某种特征结合在一起，进行共同活动、相互交往，就形成了群体。 4. 遗传平衡定律(又称哈迪.温伯格定律)： 一个不发生突变、迁移和选择的无限大的相互交配的群体中，群体的基因频率...
... ssh免密登录的过程我们已经清楚了，现在来说说是怎么回事，为什么和我们想象的不一样。 ssh-keygen的过程，其实不光生成了id_rsa.pub，同时还生成了id_rsa这个文件，这个文件就是私钥，保存在本机的。ssh远程登录的过程，...